More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0023 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  100 
 
 		 215 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  74.64 
 
 		 224 aa  318  5e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  73.81 
 
 		 212 aa  311  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  66.02 
 
 		 215 aa  276  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  62.93 
 
 		 211 aa  275  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  53.37 
 
 		 214 aa  214  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  51.42 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  50.47 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  50.23 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  53.97 
 
 		 213 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  46.19 
 
 		 213 aa  191  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0128  dTMP kinase  56.07 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  46.23 
 
 		 686 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.58 
 
 		 206 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  50.71 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  46.57 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  45.45 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  45.28 
 
 		 225 aa  173  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 686 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  52.36 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  45.97 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.76 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  41.35 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  42.52 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  51.31 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  44.19 
 
 		 671 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  44.29 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  46.98 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  41.63 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  46.45 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  41.26 
 
 		 204 aa  168  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  42.31 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  39.51 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  48.22 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  42.47 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  43.66 
 
 		 703 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  48.22 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  45.33 
 
 		 705 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  43.93 
 
 		 688 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  44.02 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  43.54 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  43.38 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  42.52 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  47.26 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  41.94 
 
 		 229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  46.34 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  40.89 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  45.07 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  42.06 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  43.13 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 707 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  40.69 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  48.21 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  44.81 
 
 		 688 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  45.18 
 
 		 901 aa  161  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  41.98 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  48.73 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 209 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  46.77 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  48.73 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  41.48 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  47.93 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  46.32 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  43.13 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 202 aa  157  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  40.76 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  45.37 
 
 		 197 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  39.25 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  40.67 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  40.95 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  40.48 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  45.73 
 
 		 662 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  40.65 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  41.23 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  40 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  47.72 
 
 		 211 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 208 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  45.45 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  43.33 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  39.34 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  48.04 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  42.11 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  42.03 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  40.48 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  47.37 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  40.48 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>