80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0022 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
361 aa  730  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  79.03 
 
 
347 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  65.96 
 
 
347 aa  446  1e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  58.05 
 
 
343 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  44.84 
 
 
361 aa  312  6e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  47.98 
 
 
343 aa  294  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 
366 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 
348 aa  214  2e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  37.81 
 
 
375 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  35.91 
 
 
388 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  37.85 
 
 
384 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  35.91 
 
 
386 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  35.51 
 
 
328 aa  197  2e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
377 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.86707e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  35.64 
 
 
375 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 
371 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  37.22 
 
 
387 aa  186  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.76986e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  35.05 
 
 
321 aa  179  6e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  37.42 
 
 
320 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
315 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.75278e-06  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  34.63 
 
 
327 aa  178  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  37.92 
 
 
295 aa  173  4e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 
336 aa  172  6e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  4.07652e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 
315 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  37.07 
 
 
322 aa  169  7e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  31.83 
 
 
344 aa  169  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  5.85513e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 
531 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  33.89 
 
 
528 aa  165  1e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 
534 aa  164  2e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.45 
 
 
314 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.4521e-07 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  31.04 
 
 
344 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.45 
 
 
314 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.45 
 
 
314 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.45 
 
 
314 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.45 
 
 
314 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.61541e-58 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.45 
 
 
314 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.45 
 
 
314 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.45 
 
 
314 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.16143e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.45 
 
 
314 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.45 
 
 
314 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  34.19 
 
 
534 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.45 
 
 
318 aa  159  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
336 aa  158  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.41 
 
 
313 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.41 
 
 
313 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  34.42 
 
 
324 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.3339e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  33.1 
 
 
313 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.09 
 
 
313 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  33.81 
 
 
325 aa  150  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.6208e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  32.39 
 
 
313 aa  148  1e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  34.3 
 
 
376 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
354 aa  143  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  32.17 
 
 
316 aa  142  9e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  31.14 
 
 
314 aa  140  4e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  28.62 
 
 
323 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  28.62 
 
 
323 aa  139  9e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  33.22 
 
 
333 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  27.83 
 
 
326 aa  127  2e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 
295 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 
317 aa  122  1e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  31.83 
 
 
330 aa  118  1e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  31.87 
 
 
327 aa  118  2e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  27.07 
 
 
326 aa  115  1e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  27.5 
 
 
352 aa  115  1e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  27.57 
 
 
313 aa  106  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 
309 aa  90.9  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 
309 aa  84.7  2e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 
228 aa  65.5  1e-09  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
228 aa  65.1  2e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  32.19 
 
 
228 aa  64.3  3e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
228 aa  64.3  3e-09  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  29.68 
 
 
249 aa  60.1  5e-08  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  30.57 
 
 
320 aa  59.7  7e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  8.87406e-15 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2021  metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 
287 aa  55.8  1e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  3.15761e-05  decreased coverage  2.41246e-08 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0254  metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 
320 aa  54.3  3e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00126604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2132  metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 
187 aa  52.4  1e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2313  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0277696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2355  metal dependent phosphohydrolase  36.49 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0025797  decreased coverage  2.15512e-05 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1835  metal dependent phosphohydrolase  30.25 
 
 
212 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.930216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  30.84 
 
 
575 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>