229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0017 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  100 
 
 
254 aa  531  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  39.62 
 
 
257 aa  196  4e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  40 
 
 
257 aa  195  5e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  34.66 
 
 
249 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0313  putative methyltransferase  32.56 
 
 
257 aa  124  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.459942  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  32.42 
 
 
259 aa  122  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  32.03 
 
 
253 aa  118  8e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29451  hypothetical protein  31.75 
 
 
249 aa  110  2e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0312  hypothetical protein  40.3 
 
 
142 aa  103  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.763248  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  30.53 
 
 
258 aa  102  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  36.42 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  35.95 
 
 
256 aa  85.5  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  36.55 
 
 
242 aa  84.3  2e-15  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  41.89 
 
 
255 aa  84.3  2e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  31.74 
 
 
251 aa  84.3  2e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  38.64 
 
 
259 aa  83.6  3e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  32.75 
 
 
251 aa  83.6  3e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  31.74 
 
 
251 aa  83.6  3e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  31.74 
 
 
251 aa  83.6  3e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  31.74 
 
 
251 aa  83.2  4e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
254 aa  82.8  5e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  31.74 
 
 
251 aa  82.4  6e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  31.74 
 
 
251 aa  82.4  6e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.44 
 
 
265 aa  81.6  1e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  35.61 
 
 
257 aa  81.3  1e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  38.85 
 
 
255 aa  78.2  1e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  36.57 
 
 
246 aa  76.3  4e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  37.68 
 
 
239 aa  76.3  5e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  37.68 
 
 
239 aa  75.9  6e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  37.68 
 
 
239 aa  75.9  6e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.67 
 
 
308 aa  75.5  8e-13  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  28.5 
 
 
252 aa  75.5  8e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  37.78 
 
 
242 aa  75.5  9e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  26.7 
 
 
267 aa  75.1  9e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
263 aa  75.1  1e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  35.56 
 
 
243 aa  75.1  1e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
261 aa  74.3  2e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
259 aa  74.3  2e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
248 aa  72.4  7e-12  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  28.79 
 
 
257 aa  72.4  7e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
242 aa  71.2  1e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 
256 aa  71.6  1e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
271 aa  70.1  4e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  38.3 
 
 
255 aa  68.9  7e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
254 aa  67.8  1e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 
243 aa  68.2  1e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  24.42 
 
 
277 aa  68.2  1e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  37.96 
 
 
255 aa  67.8  2e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 
255 aa  67.4  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  33.85 
 
 
250 aa  67.4  2e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 
255 aa  67.4  2e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  35.38 
 
 
254 aa  67.8  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
275 aa  67  3e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  35.95 
 
 
254 aa  65.1  1e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  36.64 
 
 
260 aa  64.3  2e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  32.31 
 
 
250 aa  62  9e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  37.98 
 
 
270 aa  61.2  1e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 
252 aa  61.2  2e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 
256 aa  60.8  2e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  33.08 
 
 
279 aa  60.8  2e-08  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
276 aa  59.3  5e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
253 aa  58.9  7e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  29.45 
 
 
263 aa  58.5  9e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.09 
 
 
280 aa  57.8  2e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
203 aa  57.4  2e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3499  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
256 aa  57.8  2e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
256 aa  57  3e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 
261 aa  56.6  4e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
260 aa  56.6  4e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  36 
 
 
264 aa  55.8  6e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1774  methyltransferase type 11  33.52 
 
 
261 aa  55.8  6e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
273 aa  55.8  7e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  29.13 
 
 
254 aa  55.5  8e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 
284 aa  55.5  8e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  26.09 
 
 
268 aa  55.5  9e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4692  methyltransferase type 11  37.74 
 
 
259 aa  55.5  9e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  0.0428157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  22.81 
 
 
278 aa  55.1  1e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  22.22 
 
 
250 aa  54.3  2e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 
252 aa  54.3  2e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.25 
 
 
258 aa  53.9  3e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
252 aa  53.5  3e-06  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  30.15 
 
 
273 aa  53.5  3e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3479  methyltransferase type 11  34 
 
 
252 aa  53.5  3e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0924796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  23.18 
 
 
250 aa  53.1  4e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
260 aa  53.1  4e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
178 aa  52.8  6e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  28.7 
 
 
312 aa  52  8e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  34.51 
 
 
250 aa  52  9e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  27.05 
 
 
275 aa  51.6  1e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 
223 aa  51.6  1e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  24.54 
 
 
257 aa  51.2  1e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
280 aa  51.6  1e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
266 aa  50.8  2e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  31.34 
 
 
255 aa  50.8  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
226 aa  51.2  2e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
264 aa  51.2  2e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
248 aa  50.4  2e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
248 aa  50.8  2e-05  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>