More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0016 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  100 
 
 
263 aa  530  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  45.83 
 
 
253 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  45.16 
 
 
237 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  39.52 
 
 
244 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  34.54 
 
 
253 aa  167  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  33.73 
 
 
253 aa  166  3e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  33.73 
 
 
253 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  31.42 
 
 
263 aa  159  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  33.96 
 
 
263 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  37.25 
 
 
241 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  37.4 
 
 
256 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  32.53 
 
 
247 aa  147  2e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  38.15 
 
 
249 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  24.11 
 
 
247 aa  105  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  1.4669e-07 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  29.5 
 
 
256 aa  79.7  5e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.4 
 
 
556 aa  79.3  5e-14  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.17 
 
 
545 aa  76.6  4e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  27.84 
 
 
564 aa  76.6  4e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  28.85 
 
 
254 aa  74.7  2e-12  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  26.89 
 
 
578 aa  74.7  2e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.85 
 
 
562 aa  72.4  7e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  29.23 
 
 
561 aa  72  1e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  30.6 
 
 
562 aa  70.5  3e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  29.01 
 
 
561 aa  70.5  3e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.09 
 
 
561 aa  69.7  4e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.09 
 
 
561 aa  69.7  4e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.12 
 
 
562 aa  70.1  4e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.09 
 
 
561 aa  70.1  4e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.74 
 
 
581 aa  68.9  8e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.15 
 
 
568 aa  68.6  1e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  37.5 
 
 
250 aa  66.6  4e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.74 
 
 
232 aa  65.9  7e-10  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  35.11 
 
 
246 aa  65.1  1e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  30 
 
 
263 aa  63.9  2e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  34 
 
 
227 aa  64.3  2e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  34 
 
 
227 aa  63.9  3e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  30.67 
 
 
254 aa  63.2  4e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 
562 aa  62.4  8e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 
562 aa  62.4  8e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 
562 aa  62.4  8e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 
562 aa  62.4  8e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 
562 aa  62.4  8e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 
562 aa  62.4  8e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 
562 aa  62.4  8e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  25 
 
 
249 aa  61.6  1e-08  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  7.72544e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  53.7 
 
 
237 aa  61.2  2e-08  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1377  putative UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.16 
 
 
238 aa  60.1  3e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  32 
 
 
261 aa  60.1  4e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  25.19 
 
 
262 aa  59.7  4e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  30.37 
 
 
241 aa  58.2  1e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  42.86 
 
 
257 aa  57.4  2e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5251  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  40.59 
 
 
465 aa  56.2  5e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271448  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  48.28 
 
 
243 aa  55.5  8e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  44.64 
 
 
234 aa  55.5  9e-07  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  48.28 
 
 
228 aa  55.1  1e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  43.33 
 
 
240 aa  54.7  1e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  41.43 
 
 
253 aa  55.5  1e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  43.33 
 
 
240 aa  54.7  1e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5261  Nucleotidyl transferase  46.55 
 
 
236 aa  54.3  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2631  nucleotidyl transferase  44.83 
 
 
239 aa  53.9  2e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311513  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  43.1 
 
 
240 aa  54.3  2e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  44.83 
 
 
239 aa  54.7  2e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0194  nucleotidyl transferase  44.07 
 
 
247 aa  54.3  2e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0983981 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  30.04 
 
 
436 aa  53.5  3e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14401  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  38.1 
 
 
236 aa  53.5  3e-06  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  44.83 
 
 
239 aa  53.9  3e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0501  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  42.86 
 
 
460 aa  53.1  4e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0101066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  45.76 
 
 
245 aa  53.1  5e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  49.09 
 
 
401 aa  53.1  5e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0068  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  49.09 
 
 
466 aa  52.8  5e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923003  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  45.28 
 
 
245 aa  53.1  5e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  44.83 
 
 
221 aa  52.4  7e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  50 
 
 
399 aa  52.4  8e-06  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  43.4 
 
 
247 aa  52  9e-06  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  43.4 
 
 
383 aa  51.6  1e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  30.39 
 
 
248 aa  51.6  1e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50310  sugar nucleotidyltransferase  33.63 
 
 
220 aa  51.2  1e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  5.7924e-05  hitchhiker  0.000309665 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  29.23 
 
 
630 aa  52  1e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2837  nucleotidyl transferase  41.3 
 
 
220 aa  51.6  1e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0282356  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  44.83 
 
 
232 aa  50.8  2e-05  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  28.42 
 
 
241 aa  50.8  2e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1076  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  34.38 
 
 
456 aa  50.8  2e-05  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  2.43207e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  28.57 
 
 
300 aa  50.8  2e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.94318e-05 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  43.4 
 
 
384 aa  50.8  2e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  44.07 
 
 
239 aa  50.8  2e-05  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0771  hypothetical protein  25.31 
 
 
1022 aa  51.2  2e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21940  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase /glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  41.27 
 
 
470 aa  51.2  2e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00311649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  29.2 
 
 
242 aa  51.2  2e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  42.11 
 
 
222 aa  51.2  2e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  41.38 
 
 
237 aa  50.4  3e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  43.4 
 
 
384 aa  50.4  3e-05  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  43.1 
 
 
249 aa  50.4  3e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  35.96 
 
 
522 aa  50.4  3e-05  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.34 
 
 
397 aa  50.1  3e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0085  nucleotidyl transferase  43.86 
 
 
272 aa  50.1  4e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  37.93 
 
 
220 aa  50.1  4e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_002936  DET0205  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  37.29 
 
 
236 aa  50.1  4e-05  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  44.78 
 
 
252 aa  50.1  4e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3958  nucleotidyl transferase  46.55 
 
 
271 aa  49.7  5e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3308  nucleotidyl transferase  46.55 
 
 
271 aa  49.7  5e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>