More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0015 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0015  peptidase C26  100 
 
 
207 aa  414  1e-115  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0676667 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3393  peptidase C26  38.94 
 
 
213 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0661  peptidase C26  33.67 
 
 
212 aa  127  1e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.576889 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1405  peptidase C26  32.38 
 
 
209 aa  115  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0315  conserved hypothetical protein, putative glutamine amidotransferase  31.05 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5513  glutamine amidotransferase class-I  37.37 
 
 
198 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12660  predicted glutamine amidotransferase  35.68 
 
 
218 aa  92  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1416  class I glutamine amidotransferase, putative  25.37 
 
 
200 aa  92  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0610081  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29431  hypothetical protein  32.39 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0772  peptidase C26  35.92 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0727  hypothetical protein  37.04 
 
 
200 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7109  hypothetical protein  31.58 
 
 
204 aa  81.3  9e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 
238 aa  81.3  9e-15  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1750  hypothetical protein  24.73 
 
 
179 aa  80.9  1e-14  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  35.68 
 
 
278 aa  78.2  9e-14  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  35.68 
 
 
278 aa  78.2  9e-14  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  34.71 
 
 
238 aa  73.9  2e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  27.05 
 
 
242 aa  73.6  2e-12  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  29.94 
 
 
238 aa  73.2  2e-12  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1631  glutamine amidotransferase class-I  28.08 
 
 
194 aa  73.6  2e-12  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  32.31 
 
 
248 aa  72.4  5e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  36.81 
 
 
233 aa  72  6e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  32.66 
 
 
253 aa  71.6  7e-12  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  33.33 
 
 
255 aa  71.2  1e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  34.76 
 
 
262 aa  71.2  1e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  33.17 
 
 
250 aa  70.9  1e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2706  glutamine amidotransferase  38.56 
 
 
249 aa  70.5  2e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  32.82 
 
 
241 aa  69.7  3e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  37.09 
 
 
246 aa  70.1  3e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  33.83 
 
 
250 aa  69.3  4e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  32.46 
 
 
250 aa  69.3  4e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  37.36 
 
 
235 aa  69.3  4e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  39.53 
 
 
272 aa  68.9  5e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  30.04 
 
 
244 aa  68.6  7e-11  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  38.29 
 
 
251 aa  68.2  8e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  34.57 
 
 
250 aa  67.4  1e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.59832e-05 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  34.55 
 
 
240 aa  67.8  1e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  34.55 
 
 
251 aa  67.8  1e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  38.89 
 
 
252 aa  67.8  1e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  34.57 
 
 
250 aa  67.4  1e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  31.46 
 
 
250 aa  67.4  1e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  34.55 
 
 
240 aa  67.8  1e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  37.68 
 
 
254 aa  66.6  3e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  37.96 
 
 
257 aa  66.2  3e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  38.29 
 
 
231 aa  66.6  3e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2121  peptidase C26  39.71 
 
 
253 aa  65.9  4e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0384981  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  29.75 
 
 
259 aa  65.9  4e-10  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  36.11 
 
 
253 aa  65.9  4e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  36.11 
 
 
253 aa  65.9  4e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  32.49 
 
 
256 aa  65.9  4e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2941  glutamine amidotransferase related enzyme  30.64 
 
 
237 aa  65.9  4e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  36.11 
 
 
253 aa  65.9  4e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  33.91 
 
 
233 aa  65.9  4e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.15799e-06  hitchhiker  6.99279e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  36.11 
 
 
253 aa  65.9  4e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  28.91 
 
 
241 aa  65.5  6e-10  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.0649e-07  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  37.23 
 
 
257 aa  65.1  7e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1786  peptidase C26  36.5 
 
 
257 aa  64.7  9e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  33.7 
 
 
264 aa  64.3  1e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  35.42 
 
 
253 aa  63.9  2e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  30.43 
 
 
241 aa  63.5  2e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  34.94 
 
 
280 aa  63.9  2e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  32.98 
 
 
239 aa  63.5  2e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  35.42 
 
 
253 aa  62.8  3e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  28.77 
 
 
264 aa  63.2  3e-09  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  2.8221e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  35.42 
 
 
253 aa  62.8  3e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  38.52 
 
 
255 aa  62.4  4e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  38.06 
 
 
250 aa  62.4  4e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  24.14 
 
 
238 aa  62.4  5e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  34.36 
 
 
240 aa  61.6  7e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  27.32 
 
 
279 aa  60.8  1e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  29.76 
 
 
312 aa  61.2  1e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  32.16 
 
 
253 aa  61.2  1e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  28.04 
 
 
231 aa  60.8  1e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  33.33 
 
 
267 aa  60.8  1e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  36.02 
 
 
243 aa  60.8  1e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  37.78 
 
 
249 aa  60.8  1e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  30.65 
 
 
254 aa  60.5  2e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  33.82 
 
 
254 aa  60.1  2e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1099  peptidase C26  32.07 
 
 
243 aa  60.5  2e-08  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  37.04 
 
 
255 aa  60.5  2e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  32 
 
 
264 aa  59.3  4e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  33.85 
 
 
229 aa  59.3  4e-08  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  32.92 
 
 
237 aa  59.3  4e-08  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  26.56 
 
 
238 aa  59.3  4e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.24945e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0971  peptidase C26  33.82 
 
 
253 aa  59.3  4e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.174488  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  32 
 
 
264 aa  58.9  5e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  36.3 
 
 
255 aa  58.9  5e-08  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  34.72 
 
 
253 aa  58.5  6e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  33.33 
 
 
260 aa  58.9  6e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  34.56 
 
 
253 aa  58.5  7e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1339  peptidase C26  35.2 
 
 
253 aa  58.5  7e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  28.71 
 
 
238 aa  58.2  9e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  28.3 
 
 
253 aa  58.2  9e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  34.07 
 
 
254 aa  58.2  9e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  33.58 
 
 
267 aa  58.2  9e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  29.69 
 
 
244 aa  57.8  1e-07  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2902  glutamine amidotransferase, putative  37.59 
 
 
254 aa  57.8  1e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00530511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  32.52 
 
 
245 aa  56.6  2e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  36.3 
 
 
259 aa  57  2e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  30.81 
 
 
237 aa  56.6  2e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>