More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0013 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  100 
 
 
307 aa  640  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  89.25 
 
 
307 aa  582  1e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  86.93 
 
 
307 aa  561  1e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  77.2 
 
 
307 aa  502  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  74.92 
 
 
307 aa  493  1e-138  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  73.29 
 
 
308 aa  459  1e-128  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  69.16 
 
 
309 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.91041e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  70 
 
 
323 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.56456e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  62.9 
 
 
309 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  63.87 
 
 
311 aa  405  1e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  9.08669e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0353  fructose-bisphosphate aldolase  59.49 
 
 
325 aa  367  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.198569  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2822  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  55.73 
 
 
320 aa  355  7e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.85169e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1329  fructose-bisphosphate aldolase  56.59 
 
 
324 aa  350  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569053  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1253  fructose-bisphosphate aldolase  55.95 
 
 
324 aa  349  3e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.750489  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1021  fructose-bisphosphate aldolase  55.63 
 
 
324 aa  348  5e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0751312  normal  0.0186184 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0728  fructose-bisphosphate aldolase  55.59 
 
 
324 aa  346  3e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1045  fructose-bisphosphate aldolase  56.23 
 
 
324 aa  346  4e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  4.68946e-09  unclonable  1.68547e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1325  fructose-bisphosphate aldolase  55.59 
 
 
374 aa  345  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1362  fructose-bisphosphate aldolase  55.27 
 
 
324 aa  341  7e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2253  fructose-bisphosphate aldolase  52.38 
 
 
327 aa  339  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2033  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  53.25 
 
 
325 aa  333  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  8.57052e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0949  fructose-bisphosphate aldolase  52.56 
 
 
325 aa  330  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0554404  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  50.32 
 
 
313 aa  311  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  51.14 
 
 
330 aa  308  5e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  50 
 
 
313 aa  307  2e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  48.71 
 
 
328 aa  301  1e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  47.28 
 
 
312 aa  298  6e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1489  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  50.76 
 
 
354 aa  298  8e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156888  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  51.21 
 
 
354 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0503  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  52.72 
 
 
354 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1272  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  47.83 
 
 
311 aa  292  4e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21247  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0291  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.02 
 
 
354 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0178057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  49.35 
 
 
284 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1613  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  49.36 
 
 
344 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.690914 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0480  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  49.39 
 
 
354 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0493  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  49.39 
 
 
354 aa  284  1e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2673  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000776519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3869  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.42 
 
 
354 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.652473  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  47.83 
 
 
316 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2546  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0672  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  0.967694 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.38 
 
 
284 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2626  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0937863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2655  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2015  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0573  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.48 
 
 
354 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0841  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4630  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.42 
 
 
354 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0594  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0997  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0665  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  279  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0299  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0267498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5957  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  279  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.67865  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2428  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0040  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0836  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  48.32 
 
 
307 aa  279  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1518  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.42 
 
 
345 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  9.80725e-05  decreased coverage  7.6105e-05 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0204  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.2 
 
 
354 aa  278  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5097  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.2 
 
 
354 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3596  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.57 
 
 
354 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  8.79946e-05 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2889  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.4 
 
 
354 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4316  fructose-bisphosphate aldolase, class II  48.88 
 
 
355 aa  276  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  48.8 
 
 
308 aa  275  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  46.41 
 
 
283 aa  275  7e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0935  fructose-bisphosphate aldolase, class II  47.88 
 
 
370 aa  274  1e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0461  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.25 
 
 
354 aa  275  1e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.671902  normal  0.237356 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1815  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.67 
 
 
354 aa  273  2e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.267172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2386  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  45.87 
 
 
354 aa  274  2e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1530  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.67 
 
 
354 aa  273  2e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3275  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.9 
 
 
354 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.25 
 
 
286 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  46.6 
 
 
284 aa  273  4e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.27011e-05  hitchhiker  7.97391e-05 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0691  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.9 
 
 
354 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.858155  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2793  fructose-bisphosphate aldolase  45.87 
 
 
345 aa  271  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4576  fructose-bisphosphate aldolase  47.27 
 
 
354 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3624  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.88 
 
 
345 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113592  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0384  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.29 
 
 
354 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  47.02 
 
 
305 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2243  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.46 
 
 
349 aa  269  4e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0152373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.73 
 
 
284 aa  269  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4747  fructose-bisphosphate aldolase, class II  47.11 
 
 
354 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2995  ketose-bisphosphate aldolase  48.04 
 
 
316 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.273933  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2029  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  44.82 
 
 
359 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.394674  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3218  fructose-bisphosphate aldolase  47.27 
 
 
354 aa  266  3e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.44 
 
 
283 aa  265  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1443  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.08 
 
 
357 aa  265  7e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal  0.139145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3022  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  46.03 
 
 
338 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0405  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.37 
 
 
354 aa  263  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.841441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  45.67 
 
 
284 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.22 
 
 
347 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105194  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  44.66 
 
 
287 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2447  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.34 
 
 
345 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2804  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.65 
 
 
354 aa  259  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4787  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.67 
 
 
354 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0765  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.54 
 
 
363 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.290883  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0390  fructose-bisphosphate aldolase, class II  46.98 
 
 
354 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0994  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.68 
 
 
359 aa  258  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  0.788402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07230  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.03 
 
 
354 aa  258  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0967  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.68 
 
 
359 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>