187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0004 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  57.86 
 
 
572 aa  662  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  76.55 
 
 
575 aa  915  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  61.45 
 
 
580 aa  715  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  100 
 
 
584 aa  1190  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  55.42 
 
 
582 aa  601  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  49.83 
 
 
572 aa  536  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  41.32 
 
 
575 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  40.24 
 
 
584 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  29.68 
 
 
404 aa  122  2e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  28.76 
 
 
403 aa  111  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  27.71 
 
 
406 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  30.13 
 
 
403 aa  104  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  26.46 
 
 
403 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  25.06 
 
 
403 aa  95.5  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  25.77 
 
 
400 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  25.51 
 
 
400 aa  91.3  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  27.23 
 
 
400 aa  91.3  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  28.17 
 
 
443 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  23.18 
 
 
404 aa  89.7  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  28.65 
 
 
397 aa  85.1  3e-15  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  24.87 
 
 
403 aa  85.1  3e-15  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  26.15 
 
 
389 aa  78.2  4e-13  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  26.26 
 
 
749 aa  77.4  8e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  27.95 
 
 
752 aa  77  9e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  29.48 
 
 
420 aa  75.1  3e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  24.51 
 
 
769 aa  74.3  5e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  25.48 
 
 
752 aa  68.6  3e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  28.25 
 
 
404 aa  67.4  6e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  23.43 
 
 
746 aa  66.6  1e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  29.38 
 
 
420 aa  67  1e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  25.48 
 
 
424 aa  65.9  2e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  26.54 
 
 
388 aa  65.1  3e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  27.07 
 
 
745 aa  64.7  4e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  25.21 
 
 
750 aa  64.7  5e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  26.74 
 
 
745 aa  61.6  4e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  27.81 
 
 
391 aa  61.6  4e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  26.74 
 
 
745 aa  61.6  4e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  27.17 
 
 
745 aa  61.2  5e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  26.5 
 
 
410 aa  61.2  5e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  29.63 
 
 
757 aa  60.5  9e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  28.02 
 
 
745 aa  58.9  3e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  25.99 
 
 
426 aa  58.5  3e-07  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  23.93 
 
 
618 aa  57.8  6e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  4.20617e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  27.53 
 
 
734 aa  57.4  7e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  25.87 
 
 
405 aa  57.4  7e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  25 
 
 
727 aa  56.6  1e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  26.04 
 
 
555 aa  56.6  1e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  26.9 
 
 
734 aa  56.2  2e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47492  predicted protein  26.74 
 
 
640 aa  53.9  8e-06  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00475484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  28.17 
 
 
587 aa  53.1  1e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
361 aa  53.1  1e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31061e-06 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  30.23 
 
 
706 aa  52.4  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  30.84 
 
 
756 aa  52.4  2e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
543 aa  52  3e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  30.84 
 
 
763 aa  52.4  3e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  30.84 
 
 
763 aa  52.4  3e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2565  hypothetical protein  27.73 
 
 
576 aa  52  3e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2932  hypothetical protein  29.32 
 
 
578 aa  52  3e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.59994e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39610  hypothetical protein  26.75 
 
 
616 aa  51.6  4e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.812583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  27.92 
 
 
728 aa  51.6  4e-05  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.08 
 
 
884 aa  51.6  4e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  30.84 
 
 
763 aa  51.2  5e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  30.84 
 
 
716 aa  51.2  5e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0612  hypothetical protein  28.96 
 
 
582 aa  51.2  5e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.166851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.46 
 
 
542 aa  51.2  6e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  31.36 
 
 
628 aa  50.8  7e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  28.43 
 
 
728 aa  50.8  7e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
301 aa  50.8  7e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  25.24 
 
 
728 aa  50.4  8e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  25.49 
 
 
727 aa  50.4  9e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  31.46 
 
 
769 aa  50.4  9e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  28.8 
 
 
732 aa  50.4  9e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  26.83 
 
 
734 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  30.68 
 
 
706 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  28.38 
 
 
586 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  30.37 
 
 
766 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
295 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 
808 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 
827 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1265  hypothetical protein  28.12 
 
 
584 aa  49.7  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  27.02 
 
 
734 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03820  Cell division control protein 16, putative  24.7 
 
 
840 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  26.67 
 
 
728 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.57 
 
 
595 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  28.05 
 
 
742 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  30.37 
 
 
844 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
301 aa  48.5  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.62 
 
 
237 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  30.93 
 
 
269 aa  48.9  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  21.73 
 
 
762 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.59 
 
 
1056 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1226  hypothetical protein  34.57 
 
 
243 aa  48.9  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 
245 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  28.34 
 
 
742 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  27.33 
 
 
937 aa  48.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  35.8 
 
 
1979 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  27.69 
 
 
735 aa  48.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
732 aa  48.5  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
452 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  28.34 
 
 
742 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>