More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0029 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  82.51 
 
 		 3129 bp  718    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0008  23S ribosomal RNA  82.45 
 
 		 3357 bp  700    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2933 bp  805    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2933 bp  797    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  83.59 
 
 		 2933 bp  789    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0003  23S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 3009 bp  5949    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.168115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  83.59 
 
 		 2933 bp  789    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  83.59 
 
 		 2935 bp  789    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  83.51 
 
 		 2933 bp  781    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0041  23S ribosomal RNA  85.73 
 
 		 3027 bp  833    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0513089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0027  23S ribosomal RNA  83.81 
 
 		 2927 bp  793    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0070  23S ribosomal RNA  83.81 
 
 		 2927 bp  793    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  82.51 
 
 		 3129 bp  718    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0031  23S ribosomal RNA  82.45 
 
 		 3357 bp  700    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  82.51 
 
 		 3129 bp  718    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0029  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 3009 bp  5965    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.795841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  82.51 
 
 		 3129 bp  718    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0010  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 		 2927 bp  777    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  83.51 
 
 		 2933 bp  781    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  83.59 
 
 		 2933 bp  789    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  83.59 
 
 		 2932 bp  789    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  83.59 
 
 		 2933 bp  789    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0004  23S ribosomal RNA  83.72 
 
 		 2928 bp  785    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0025  23S ribosomal RNA  85.73 
 
 		 3027 bp  833    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0037  23S ribosomal RNA  83.81 
 
 		 2927 bp  793    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0024  23S ribosomal RNA  83.72 
 
 		 2927 bp  785    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  83.72 
 
 		 2927 bp  785    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0066  23S ribosomal RNA  83.72 
 
 		 2927 bp  785    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0018  23S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 2923 bp  618  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.193918  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0069  23S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 2923 bp  618  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0064  23S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 2923 bp  618  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.65244  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0019  23S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 2923 bp  618  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0080  23S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 2923 bp  618  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0069  23S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 2923 bp  618  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0064  23S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 2923 bp  618  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0080  23S ribosomal RNA  81.95 
 
 		 2923 bp  618  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0006  23S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 2923 bp  611  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0006  23S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 2923 bp  611  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0021  23S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 2923 bp  611  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0022  23S ribosomal RNA  81.86 
 
 		 2923 bp  611  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SA  23S ribosomal RNA  81.78 
 
 		 2922 bp  603  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SB  23S ribosomal RNA  81.78 
 
 		 2922 bp  603  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0486187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SC  23S ribosomal RNA  81.78 
 
 		 2922 bp  603  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SD  23S ribosomal RNA  81.78 
 
 		 2922 bp  603  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SE  23S ribosomal RNA  81.78 
 
 		 2922 bp  603  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SF  23S ribosomal RNA  81.78 
 
 		 2922 bp  603  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0015  23S ribosomal RNA  88.73 
 
 		 2972 bp  593  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.544354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0023  23S ribosomal RNA  82.53 
 
 		 3000 bp  581  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0035  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 		 2969 bp  531  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0006  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 		 2969 bp  531  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0054  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 		 2969 bp  531  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0027  23S ribosomal RNA  81.6 
 
 		 3023 bp  521  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.26037  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0036  23S ribosomal RNA  81.82 
 
 		 2934 bp  513  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0009  23S ribosomal RNA  86.83 
 
 		 2961 bp  511  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.609775  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0038  23S ribosomal RNA  81.93 
 
 		 2969 bp  496  1e-137  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.620142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0055  23S ribosomal RNA  81.93 
 
 		 2969 bp  496  1e-137  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0373093 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0062  23S ribosomal RNA  87.36 
 
 		 2972 bp  496  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0059  23S ribosomal RNA  87.36 
 
 		 2972 bp  496  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0139247  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0013  23S ribosomal RNA  81.93 
 
 		 2969 bp  496  1e-137  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0756826  normal  0.599313 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0032  23S ribosomal RNA  87.36 
 
 		 2972 bp  496  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.922889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0009  23S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 2912 bp  492  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.363949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0020  23S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 3062 bp  492  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000158535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0064  23S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 2912 bp  492  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00853635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0079  23S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 2913 bp  492  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0020  23S ribosomal RNA  84.5 
 
 		 3039 bp  490  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.944496  normal  0.114862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0056  23S ribosomal RNA  84.5 
 
 		 3039 bp  490  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.826455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0012  23S ribosomal RNA  84.5 
 
 		 3039 bp  490  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0471385  normal  0.17133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0071  23S ribosomal RNA  86.25 
 
 		 2912 bp  484  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.19372  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0059  23S ribosomal RNA  86.53 
 
 		 2943 bp  480  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0010  23S ribosomal RNA  86.53 
 
 		 2944 bp  480  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0028  23S ribosomal RNA  86.53 
 
 		 2946 bp  480  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0002  23S ribosomal RNA  86.53 
 
 		 2944 bp  480  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0115093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0050  23S ribosomal RNA  86.53 
 
 		 2946 bp  480  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.074771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0031  23S ribosomal RNA  86.53 
 
 		 2946 bp  480  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0030  23S ribosomal RNA segment  89.25 
 
 		 3298 bp  476  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00296414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0054  23S ribosomal RNA segment  89.25 
 
 		 3298 bp  476  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.26274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0049  23S ribosomal RNA segment  89.25 
 
 		 3298 bp  476  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0008  23S ribosomal RNA segment  89.25 
 
 		 3298 bp  476  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2909 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2909 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2908 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2851 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2912 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2911 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2912 bp  458  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r14  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 2908 bp  458  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>