150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0025 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0598  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0019  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0039  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0004  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00103905  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  84.44 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  85.39 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  85.39 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0011  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00270882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1519  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428065  normal  0.832242 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0619619  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0056  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.756385 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000434442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0360515  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.873101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13650  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00181798  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0056  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21120  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21100  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0044  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0612357  normal  0.0343105 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0006  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000531495  normal  0.328026 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0830  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0029  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0406184  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0001  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0016  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0019  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.307428  hitchhiker  0.00000285444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0989322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0005  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.936331 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0020  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0042  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.552525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0007  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0422761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0027  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0020  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.311496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0028  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.491326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>