220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0015 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0051  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0020  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0060  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.481193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0031  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0053  tRNA-Gly  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000895644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0064  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.729531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0071  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00174778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0018  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0052  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0051  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0052  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0050  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0002  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00924229  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0021  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  88 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0038  tRNA-Gly  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0041  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000613233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0043  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000854209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0070  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  87.3 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0055  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  87.3 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0048  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0065  tRNA-Gly  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000604165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0037  tRNA-OTHER  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  87.3 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0096  tRNA-Gly  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000621353  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0062  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  87.3 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0001  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0026  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0028  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000319369  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0002  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  86.36 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0038  tRNA-Gly  86.36 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0025  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42192  normal  0.527647 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0075  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.29937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0078  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0389379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0079  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.556141  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0021  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.953121  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0001  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155271 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0003  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0019  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0024  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0036  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>