More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1743 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 447 aa  921    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  56.73 
 
 		 436 aa  514  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  60.18 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  26.83 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0647  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0082339  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.63 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 477 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 410 aa  96.7  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 484 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 536 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.22 
 
 		 486 aa  93.2  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.67 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 458 aa  89.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 435 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 421 aa  87.4  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 441 aa  87.4  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  20.94 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0525  extracellular solute-binding protein family 1  21.87 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180437  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.09 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  25.69 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1212  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1181  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.595766 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  22.08 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  24.56 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 477 aa  79.7  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3164  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.625995  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3021  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 487 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1283  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 513 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2670  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00030492  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  22.05 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  22.05 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  25.31 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1357  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000953949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.94 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1047  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3333  transporter, putative  25.43 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3006  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.88 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.99 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  27.37 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3144  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.85 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6371  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.970426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.15 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7356  ABC transporter, binding protein  26.03 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>