More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1723 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  45.62 
 
 
778 aa  658    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  46.1 
 
 
772 aa  662    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
756 aa  1551    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.59 
 
 
762 aa  660    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  46.67 
 
 
778 aa  659    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  44.47 
 
 
777 aa  619  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.8 
 
 
771 aa  617  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  42.73 
 
 
790 aa  609  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.65 
 
 
792 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  40.25 
 
 
805 aa  569  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.41 
 
 
784 aa  568  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.21 
 
 
807 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.1 
 
 
782 aa  556  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.9 
 
 
760 aa  547  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.96 
 
 
783 aa  530  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.9 
 
 
795 aa  530  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  37.81 
 
 
808 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  39.44 
 
 
743 aa  518  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.11 
 
 
755 aa  513  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  38.72 
 
 
859 aa  502  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.29 
 
 
799 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.86 
 
 
773 aa  498  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.7 
 
 
754 aa  476  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  38.6 
 
 
765 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.84 
 
 
760 aa  473  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  39.04 
 
 
753 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  40.91 
 
 
743 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  36.99 
 
 
788 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.84 
 
 
751 aa  467  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.69 
 
 
798 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.32 
 
 
769 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  39.07 
 
 
774 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  36.45 
 
 
802 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  38.6 
 
 
755 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  38.45 
 
 
755 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  38.45 
 
 
755 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  38.45 
 
 
765 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  36.29 
 
 
1037 aa  458  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  38.6 
 
 
755 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  38.13 
 
 
763 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  35.14 
 
 
763 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  38.63 
 
 
765 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  41.19 
 
 
772 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  35.32 
 
 
817 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  38.35 
 
 
766 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  38.63 
 
 
765 aa  452  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.48 
 
 
765 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  38.37 
 
 
763 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  38.63 
 
 
765 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  38.48 
 
 
765 aa  450  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  38.63 
 
 
765 aa  452  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.82 
 
 
751 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  38.63 
 
 
765 aa  452  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  38.11 
 
 
763 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  38.48 
 
 
765 aa  450  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.81 
 
 
801 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  37.98 
 
 
763 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.95 
 
 
768 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  38.94 
 
 
721 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  39.97 
 
 
738 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.61 
 
 
769 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.6 
 
 
806 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  38.34 
 
 
765 aa  446  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  39.31 
 
 
740 aa  445  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.67 
 
 
757 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  37.69 
 
 
768 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.95 
 
 
768 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.27 
 
 
769 aa  445  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.06 
 
 
807 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  37.13 
 
 
772 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.19 
 
 
778 aa  439  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.48 
 
 
766 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.64 
 
 
760 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.63 
 
 
785 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.81 
 
 
791 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.15 
 
 
771 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  37.17 
 
 
765 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  54.66 
 
 
966 aa  427  1e-118  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  38.34 
 
 
765 aa  429  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.6 
 
 
712 aa  428  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  41.3 
 
 
762 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  37.83 
 
 
750 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.08 
 
 
738 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02217  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  34.38 
 
 
759 aa  416  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.376318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  36.62 
 
 
763 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  36.72 
 
 
739 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.5 
 
 
804 aa  418  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.64 
 
 
752 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.26 
 
 
759 aa  418  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.84 
 
 
762 aa  419  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  37.5 
 
 
745 aa  415  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  41.37 
 
 
755 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  35.14 
 
 
759 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  34.73 
 
 
727 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  35.1 
 
 
764 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.28 
 
 
702 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.98 
 
 
760 aa  412  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  34.69 
 
 
723 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  34.73 
 
 
727 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  35.36 
 
 
764 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>