More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1596 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
287 aa  585  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  47.74 
 
 
286 aa  265  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 
300 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 
283 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2239  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 
295 aa  126  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 
276 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
298 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  27.06 
 
 
316 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1355  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 
303 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1003  transcriptional regulator, AraC family  28.14 
 
 
289 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 
273 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1237  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000177874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1393  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  21.56 
 
 
276 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  20.9 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 
686 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 
686 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 
118 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3436  AraC family transcriptional regulator  23.19 
 
 
279 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  22.78 
 
 
278 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01665  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.56 
 
 
303 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01654  hypothetical protein  24.56 
 
 
303 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  26.1 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1935  AraC family transcriptional regulator  24.56 
 
 
303 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0147604 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 
287 aa  88.2  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  23.77 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 
304 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1467  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 
296 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.145729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1451  transcriptional regulator, AraC family protein  25.82 
 
 
296 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0743909  normal  0.362871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1817  transcriptional regulator, AraC family protein  25.82 
 
 
296 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.246217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2412  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 
303 aa  87  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2310  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.59 
 
 
299 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120361  normal  0.040249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 
1201 aa  86.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1500  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 
303 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.831009  normal  0.0187399 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1946  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.192766  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  25.68 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1912  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1899  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  21.79 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35.65 
 
 
513 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1299  transcriptional regulator, AraC family  35.26 
 
 
334 aa  86.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  23.4 
 
 
278 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 
259 aa  86.3  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 
259 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2332  transcriptional regulator, AraC family  31.9 
 
 
311 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000141159  normal  0.457995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 
519 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  24.22 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.5 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1486  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.012343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  24.01 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  21.91 
 
 
278 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0251  AraC family transcriptional regulator  24.33 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1048  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 
101 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000208047  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1597  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 
204 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  27.38 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0768  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1772  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  20.45 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  39.42 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  22.48 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  34.62 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  31.73 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
517 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  31.73 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  33.1 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  22.7 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3119  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.91 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00676861  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1988  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  hitchhiker  0.00402915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>