250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1594 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0174  extracellular solute-binding protein family 1  47.51 
 
 		 951 aa  883    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.01491  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 961 aa  1958    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2274  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 		 1012 aa  612  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0294  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 		 998 aa  392  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0089  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 		 951 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 399 aa  84  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 430 aa  80.9  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.44 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.61 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 450 aa  72  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1527  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  22.55 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1634  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  19.8 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  24.42 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 449 aa  64.3  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 421 aa  63.9  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 438 aa  63.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 480 aa  63.2  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 446 aa  63.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.19 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.24 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.49 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.56 
 
 		 416 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  21.79 
 
 		 445 aa  60.1  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.18 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  26.88 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.49 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.87 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  21.45 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 441 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 405 aa  57.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 425 aa  57.4  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.38 
 
 		 444 aa  57.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  21.19 
 
 		 446 aa  57.4  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 410 aa  57.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 423 aa  57  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1045  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 488 aa  57  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0733801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 420 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 437 aa  57  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.55 
 
 		 427 aa  56.6  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 414 aa  57  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0942  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 418 aa  56.6  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.254009  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 424 aa  57  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 504 aa  57  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.67 
 
 		 431 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0476  extracellular solute-binding protein family 1  30.14 
 
 		 401 aa  57  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 411 aa  56.2  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 412 aa  55.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 422 aa  56.2  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 426 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  32.14 
 
 		 435 aa  55.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.39 
 
 		 422 aa  56.2  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2535  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 418 aa  56.2  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.105932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 429 aa  56.2  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 426 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  26.51 
 
 		 413 aa  55.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  24.54 
 
 		 427 aa  55.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.34 
 
 		 366 aa  55.5  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.39 
 
 		 422 aa  55.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 422 aa  55.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 421 aa  55.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  26.51 
 
 		 399 aa  55.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  28.34 
 
 		 423 aa  55.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.89 
 
 		 411 aa  55.1  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.6 
 
 		 410 aa  55.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  30.3 
 
 		 428 aa  55.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 434 aa  54.7  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 412 aa  54.7  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 422 aa  54.7  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.55 
 
 		 431 aa  54.7  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 429 aa  54.3  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0804  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 434 aa  54.7  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.4 
 
 		 447 aa  54.3  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 443 aa  54.3  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 412 aa  54.3  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 441 aa  54.3  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 414 aa  54.3  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  31.87 
 
 		 441 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 421 aa  54.3  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  22.02 
 
 		 410 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 419 aa  54.3  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 410 aa  53.9  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 421 aa  53.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0129  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 426 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>