66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1548 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  100 
 
 
160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  32.84 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  31.01 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  33.03 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  35.09 
 
 
155 aa  61.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  31.62 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  31.01 
 
 
300 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  29.36 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  28.32 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  27.5 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  27.5 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  27.5 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  34.15 
 
 
102 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  30.93 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  31.87 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  40.38 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  26.21 
 
 
217 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  39.29 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  39.39 
 
 
178 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  39.62 
 
 
101 aa  52  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  26.67 
 
 
170 aa  51.6  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  27.27 
 
 
179 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  33.33 
 
 
180 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  27.27 
 
 
183 aa  51.2  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  25 
 
 
187 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  35.85 
 
 
101 aa  50.8  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  33.77 
 
 
97 aa  50.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0055  protein of unknown function DUF721  30.69 
 
 
271 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  32.1 
 
 
97 aa  50.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  36.23 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  26.32 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  36.73 
 
 
206 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  23.81 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  26.37 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1572  protein of unknown function DUF721  28.77 
 
 
194 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  30.19 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  34.69 
 
 
188 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1595  protein of unknown function DUF721  28.77 
 
 
194 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.215209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  25.32 
 
 
273 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4084  hypothetical protein  35.38 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172895 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  37.74 
 
 
155 aa  44.7  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  30.61 
 
 
134 aa  44.3  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  29.29 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  24.05 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  28.81 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  28.81 
 
 
198 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0544  hypothetical protein  30 
 
 
86 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177054  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2764  protein of unknown function DUF721  41.27 
 
 
100 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.547848  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  31.25 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  30.14 
 
 
185 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0535  protein of unknown function DUF721  32.89 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.864734  hitchhiker  0.0000000114959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5457  protein of unknown function DUF721  28.41 
 
 
95 aa  41.2  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.010243  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  25.26 
 
 
173 aa  41.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  20 
 
 
177 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  25.37 
 
 
188 aa  41.2  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  31.48 
 
 
185 aa  41.2  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0216  protein of unknown function DUF721  31.11 
 
 
108 aa  40.8  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690778  normal  0.772545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3716  hypothetical protein  27.85 
 
 
105 aa  40.8  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.290608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  28.85 
 
 
166 aa  40.8  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2673  protein of unknown function DUF721  24.39 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.212988  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  33.33 
 
 
196 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  29.69 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  26.42 
 
 
156 aa  40.4  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>