More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1531 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  50.75 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  54.89 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  50 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  55.25 
 
 		 268 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  52.79 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  51.65 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  53.26 
 
 		 196 aa  180  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 283 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  52.49 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  51.01 
 
 		 283 aa  177  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 209 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  49.24 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  50 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  47.74 
 
 		 277 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  53.11 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  50 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  53.11 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  49.25 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 199 aa  174  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 198 aa  174  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  50 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  50.85 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  52.04 
 
 		 254 aa  174  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  53.8 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  50.84 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  49.25 
 
 		 218 aa  173  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  47.98 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  47.03 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  51.06 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  50.28 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  53.67 
 
 		 191 aa  171  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  53.67 
 
 		 191 aa  171  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  50 
 
 		 256 aa  171  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  51.67 
 
 		 211 aa  171  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 210 aa  171  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  51.98 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  47.51 
 
 		 211 aa  171  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  49.72 
 
 		 255 aa  171  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 211 aa  171  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  48.97 
 
 		 211 aa  171  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 207 aa  171  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 198 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  51.11 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  50 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 198 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  48.48 
 
 		 338 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  50 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  51.53 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  51.98 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  51.12 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  48.04 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  50.85 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  51.98 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  49.46 
 
 		 198 aa  168  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  168  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  50.85 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 227 aa  167  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 211 aa  167  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 205 aa  167  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  53.04 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  50.85 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  48.59 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  48.07 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  48.21 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  47.25 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  50 
 
 		 257 aa  165  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  51.35 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  48.45 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  52.43 
 
 		 196 aa  165  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  49.46 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  47.19 
 
 		 256 aa  164  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  47.85 
 
 		 227 aa  164  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>