62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1520 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 310 aa  626  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  42.09 
 
 		 295 aa  215  8e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  40.45 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  40.22 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  37.25 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  34.36 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  32.54 
 
 		 351 aa  146  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  32.52 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  27.3 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  25.89 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  24.54 
 
 		 383 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  24.18 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  21.84 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  21.27 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  21.27 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  26.09 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  28.8 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  25.77 
 
 		 331 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  24.55 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4389  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.484216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  23.35 
 
 		 371 aa  49.3  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  24.74 
 
 		 364 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3729  radical SAM domain-containing protein  21.49 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105628 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  23.29 
 
 		 379 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  21.65 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  23.79 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  23.65 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  21.26 
 
 		 338 aa  47  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  22.89 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  24.52 
 
 		 356 aa  45.8  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  22.46 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  22.91 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  22.8 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  22.5 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.16 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  23.27 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  23.4 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  22.58 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  25.14 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  18.22 
 
 		 335 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  19.79 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.35 
 
 		 485 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3644  biotin synthase  20.2 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  23.64 
 
 		 341 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  25.77 
 
 		 359 aa  42.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 360 aa  42.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0336  radical SAM domain-containing protein  23.71 
 
 		 486 aa  42.7  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.19 
 
 		 365 aa  42.7  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  25.25 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2436  biotin synthase  25.44 
 
 		 337 aa  42.4  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113139 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  25.23 
 
 		 376 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>