More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1516 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 125 aa  244  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  53.66 
 
 		 126 aa  153  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  57.02 
 
 		 126 aa  150  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  57.5 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  58.33 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 		 126 aa  147  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  52.89 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  57.76 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  53.66 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 125 aa  140  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 127 aa  140  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  139  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  53.78 
 
 		 126 aa  139  9e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  54.87 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0244  glycine cleavage system H protein  58.93 
 
 		 116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  137  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 122 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  58.47 
 
 		 122 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  49.14 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  53.57 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  52.14 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  49.57 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  52.21 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  50.44 
 
 		 135 aa  133  9e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  54.17 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  50.89 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  49.17 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  44.8 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  52.68 
 
 		 124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3154  glycine cleavage system H protein  48.28 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1662  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.293907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0338  glycine cleavage system H protein  58.93 
 
 		 125 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0357579  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  44.07 
 
 		 124 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  45.16 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  49.56 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1020  glycine cleavage system protein H  56.78 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000891205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  50.83 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>