More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1464 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1464  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  100 
 
 
440 aa  889    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0983  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  46.62 
 
 
440 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000730864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3205  hypothetical protein  42.19 
 
 
445 aa  362  6e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000023464  hitchhiker  3.0015199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3205  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.67 
 
 
447 aa  361  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1467  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.66 
 
 
444 aa  356  5e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.369998  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1630  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  43.41 
 
 
436 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0566409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0716  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.26 
 
 
448 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000599844  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0034  2-methylthioadenine synthetase  40.54 
 
 
455 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0632  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.77 
 
 
448 aa  349  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.3058599999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3124  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.5 
 
 
442 aa  349  5e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000009336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0618  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.54 
 
 
448 aa  348  9e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000754849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0678  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.77 
 
 
446 aa  347  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000258003  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.77 
 
 
430 aa  345  7e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1647  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.65 
 
 
445 aa  345  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1929  putative tRNA modifying protein  41.42 
 
 
445 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.89 
 
 
453 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000162674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.95 
 
 
450 aa  339  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000316014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1926  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.78 
 
 
444 aa  339  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0957  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.86 
 
 
430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00162656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3199  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.41 
 
 
449 aa  336  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3110  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.36 
 
 
446 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000143108  normal  0.954122 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11970  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.73 
 
 
442 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000060077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3231  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.91 
 
 
440 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.12995  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1671  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.44 
 
 
487 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.813765  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.77 
 
 
435 aa  329  7e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0470  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.19 
 
 
438 aa  326  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2498  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.5 
 
 
486 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2144  hypothetical protein  36.83 
 
 
504 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.05 
 
 
436 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146576  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3733  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.14 
 
 
441 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2512  hypothetical protein  38.22 
 
 
452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0675  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.18 
 
 
430 aa  318  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00122823  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0353  hypothetical protein  37.47 
 
 
466 aa  317  2e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1623  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.68 
 
 
452 aa  317  3e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0377  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.05 
 
 
450 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0641  hypothetical protein  38.29 
 
 
440 aa  316  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1074  hypothetical protein  39.14 
 
 
432 aa  315  9e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0865  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.18 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0318613  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1025  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.54 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.813856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3568  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.23 
 
 
471 aa  313  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0111  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.16 
 
 
469 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0100  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  36.93 
 
 
469 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0256489  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0256  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.14 
 
 
430 aa  311  1e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1262  2-methylthioadenine synthetase  38.22 
 
 
439 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.467346  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4336  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.5 
 
 
449 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4276  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.5 
 
 
449 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2337  hypothetical protein  36.51 
 
 
458 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.587976  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0839  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.76 
 
 
450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0093  hypothetical protein  36.7 
 
 
483 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1288  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.54 
 
 
431 aa  309  5.9999999999999995e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1155  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40 
 
 
427 aa  307  3e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2455  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.7 
 
 
440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000298883  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3525  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  35.89 
 
 
444 aa  306  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  36.24 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0443  MiaB family RNA modification protein  37.47 
 
 
440 aa  304  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01161  Fe-S oxidoreductase  38.04 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01181  Fe-S oxidoreductase  36.63 
 
 
454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.681569  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02161  Fe-S oxidoreductase  37.05 
 
 
472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13538  putative Fe-S oxidoreductase  38.91 
 
 
435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01141  Fe-S oxidoreductase  36.18 
 
 
454 aa  302  9e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01171  Fe-S oxidoreductase  36.4 
 
 
454 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.72418  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0106  hypothetical protein  36.57 
 
 
471 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3605  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  36.2 
 
 
436 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.757621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0653  2-methylthioadenine synthetase  35.96 
 
 
437 aa  293  6e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.835098  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0150  hypothetical protein  36.65 
 
 
434 aa  292  8e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0735  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  34.78 
 
 
463 aa  290  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1585  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  36.55 
 
 
444 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678841  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5359  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  35.51 
 
 
437 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0963  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  36.32 
 
 
442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1757  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  36.7 
 
 
431 aa  282  8.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1405  hypothetical protein  36.84 
 
 
440 aa  280  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0713  hypothetical protein  35.47 
 
 
438 aa  280  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37650  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  36.43 
 
 
440 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1760  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.3 
 
 
432 aa  280  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.7 
 
 
437 aa  279  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0588845  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26767  predicted protein  35.25 
 
 
450 aa  278  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.071035 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0783  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  33.18 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00978925  normal  0.109874 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0435  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  36.28 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3092  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  35.68 
 
 
435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.949904  normal  0.038543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1063  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  35.33 
 
 
458 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.270511  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2965  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  34.61 
 
 
441 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000711639  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1592  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  35.15 
 
 
429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000486202  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0770  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  35.11 
 
 
457 aa  270  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.579434 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1662  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  35.01 
 
 
427 aa  270  5e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00220183  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0146  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  34.92 
 
 
438 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00677283  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1513  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  34.4 
 
 
433 aa  268  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.627818  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0160  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.98 
 
 
401 aa  267  2e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0485  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  35.25 
 
 
493 aa  267  4e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2402  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  35.56 
 
 
467 aa  266  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0258  conserved hypothetical protein, radical SAM domain family (UPF0004 domain protein)  36.6 
 
 
438 aa  265  1e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1699  RNA modification enzyme, MiaB family  34.93 
 
 
478 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000319842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1713  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  35.86 
 
 
440 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00416624  normal  0.0683771 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0599  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  35.27 
 
 
472 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0506  hypothetical protein  34.4 
 
 
430 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.912527  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10700  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG, TIGR01125  33.79 
 
 
446 aa  261  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00016615  unclonable  0.00000000172933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0517  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  34.82 
 
 
472 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2609  putative tRNA modifying protein  35.06 
 
 
467 aa  260  4e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07500  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG, TIGR01125  32.21 
 
 
477 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0247514  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3627  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  34.82 
 
 
480 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0543  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  34.82 
 
 
472 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>