More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1456 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
145 aa  295  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 
150 aa  169  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.93 
 
 
145 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 
147 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  60.58 
 
 
147 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.71 
 
 
145 aa  166  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.17 
 
 
152 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 
145 aa  165  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 
150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.4 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.99 
 
 
148 aa  164  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.74 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.12 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 
156 aa  161  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 
150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  51.03 
 
 
149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
144 aa  160  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 
153 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 
153 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 
157 aa  157  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.08 
 
 
150 aa  157  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 
159 aa  156  9e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 
149 aa  155  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 
145 aa  155  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
149 aa  155  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 
152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 
144 aa  153  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 
149 aa  153  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 
142 aa  153  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 
146 aa  152  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 
146 aa  152  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 
146 aa  152  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 
146 aa  152  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 
146 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 
146 aa  152  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 
146 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 
147 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 
160 aa  152  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.35 
 
 
184 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 
148 aa  150  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 
193 aa  150  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 
150 aa  150  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 
146 aa  149  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 
146 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 
146 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.31 
 
 
155 aa  148  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.74 
 
 
142 aa  148  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
144 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 
144 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 
156 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 
144 aa  148  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 
159 aa  148  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.59 
 
 
160 aa  147  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 
146 aa  147  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  51.49 
 
 
156 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
148 aa  147  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  53.44 
 
 
144 aa  147  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 
156 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 
149 aa  146  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1719  3-dehydroquinate dehydratase  56.93 
 
 
144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0301155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 
149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.43 
 
 
142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 
145 aa  144  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.65 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  51.49 
 
 
193 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 
151 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 
145 aa  144  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 
145 aa  144  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
151 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 
145 aa  144  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 
151 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 
151 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 
151 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 
144 aa  144  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 
193 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
147 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 
150 aa  143  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 
146 aa  143  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 
144 aa  144  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 
193 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
207 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 
151 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 
146 aa  142  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 
148 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 
150 aa  142  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 
150 aa  142  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 
160 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 
162 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
151 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  50.38 
 
 
152 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>