298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1412 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.63 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  29.66 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1812  phosphoribosyltransferase  34.3 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  29.66 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  27.98 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  29.44 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  32.7 
 
 		 240 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  29.22 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0152  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.78 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0150126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  30.49 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  28.27 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  27.63 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  29.78 
 
 		 219 aa  99  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 220 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  28.63 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  30.08 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  30.81 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  26.58 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  27.01 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  26.84 
 
 		 233 aa  95.1  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  26.58 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  27.27 
 
 		 255 aa  95.1  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  28.95 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  28.77 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.26 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  31.03 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  27.65 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  30.43 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  28.99 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  30.7 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  31.39 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  26.54 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  27.5 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  28.02 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 		 269 aa  89.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  27.35 
 
 		 258 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.4 
 
 		 296 aa  89.4  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  27.66 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  29.2 
 
 		 255 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  31.19 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  28.04 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  27.66 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  27.54 
 
 		 268 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  27.97 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  27.87 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  26.92 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  25.78 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  30.52 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.78 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.96 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  28.94 
 
 		 261 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  30.5 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  26.64 
 
 		 248 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  29.52 
 
 		 241 aa  85.1  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  27.78 
 
 		 299 aa  85.1  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  26.99 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.74 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  26.7 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  27.65 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  26.55 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  27.68 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  28 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  28 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  29.72 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4395  ComF family protein  27.14 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  26.81 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  28.44 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  28.83 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  28.1 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  25.1 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  27.27 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  25.94 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  27.23 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  26.51 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  29.52 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  26.99 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  26.94 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  24.57 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  26.13 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  28.7 
 
 		 262 aa  81.6  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>