More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1378 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  76.85 
 
 
400 aa  644    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  75.06 
 
 
400 aa  639    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  76.05 
 
 
397 aa  650    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  74.57 
 
 
400 aa  640    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  76.85 
 
 
400 aa  644    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  74.81 
 
 
395 aa  635    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  78.02 
 
 
400 aa  658    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  100 
 
 
405 aa  817    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  100 
 
 
405 aa  817    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  74.57 
 
 
400 aa  641    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  76.54 
 
 
400 aa  650    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  75.06 
 
 
400 aa  639    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  76.05 
 
 
397 aa  650    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2690  translation elongation factor Tu  75.12 
 
 
405 aa  634    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000740208  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  75.12 
 
 
405 aa  634    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  75.06 
 
 
400 aa  631  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  75.06 
 
 
400 aa  631  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  74.07 
 
 
400 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  74.19 
 
 
400 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  75.12 
 
 
396 aa  628  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  75.12 
 
 
396 aa  628  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  75.19 
 
 
399 aa  629  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  75.19 
 
 
400 aa  628  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  73.58 
 
 
400 aa  625  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  73.83 
 
 
400 aa  627  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2621  translation elongation factor Tu  72.41 
 
 
405 aa  621  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169473  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  75.31 
 
 
397 aa  622  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  75.31 
 
 
397 aa  622  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1184  translation elongation factor Tu  72.17 
 
 
405 aa  619  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000189456  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  73.33 
 
 
400 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  73.33 
 
 
400 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  73.41 
 
 
405 aa  620  1e-176  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  73.41 
 
 
405 aa  620  1e-176  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1140  elongation factor Tu  72.66 
 
 
400 aa  610  1e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000019246  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  72.66 
 
 
400 aa  608  1e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  71.96 
 
 
396 aa  610  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  74.57 
 
 
395 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  72.59 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  73.4 
 
 
399 aa  605  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  69.38 
 
 
400 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  70.86 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  70.86 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  71.85 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  71.85 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  71.6 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  71.6 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  74.81 
 
 
395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  71.85 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  71.85 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  71.85 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  71.85 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  71.11 
 
 
396 aa  598  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  71.96 
 
 
396 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  72.35 
 
 
400 aa  598  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0177  elongation factor Tu  73.33 
 
 
400 aa  600  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000229884  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0192  elongation factor Tu  73.33 
 
 
400 aa  600  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174926  normal  0.0285704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  71.85 
 
 
396 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  71.85 
 
 
396 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  71.96 
 
 
396 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  69.38 
 
 
397 aa  594  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  71.11 
 
 
396 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  71.6 
 
 
395 aa  594  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  71.6 
 
 
395 aa  594  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  71.5 
 
 
397 aa  593  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1479  elongation factor Tu  73.15 
 
 
401 aa  592  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.008881  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  69.88 
 
 
396 aa  591  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3026  elongation factor Tu  73.15 
 
 
401 aa  592  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  70.72 
 
 
395 aa  593  1e-168  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  591  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  69.88 
 
 
396 aa  592  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  70.86 
 
 
396 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  70.37 
 
 
396 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  70.12 
 
 
396 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  69.02 
 
 
402 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0049  elongation factor Tu  70 
 
 
410 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  69.88 
 
 
396 aa  589  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  70.97 
 
 
395 aa  589  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>