More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1362 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  100 
 
 
146 aa  293  7e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  61.17 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  52.17 
 
 
140 aa  130  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  47.22 
 
 
139 aa  130  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  58.49 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  48.57 
 
 
142 aa  128  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  57.52 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  57.69 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  57.01 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  51.67 
 
 
156 aa  120  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  59.22 
 
 
136 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  49.3 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  54.21 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  53.4 
 
 
173 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  53.4 
 
 
173 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  53.4 
 
 
173 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  53.4 
 
 
173 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  53.4 
 
 
170 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  53.4 
 
 
173 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  53.4 
 
 
164 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  52.94 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  52.94 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  51.16 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  52.94 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  52.94 
 
 
172 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  53.4 
 
 
140 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  54.72 
 
 
150 aa  113  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  49.11 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  52.68 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  46.15 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  51.85 
 
 
188 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  48.62 
 
 
156 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  48.62 
 
 
156 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  48.62 
 
 
156 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  48.62 
 
 
156 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  47.01 
 
 
169 aa  107  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  49.53 
 
 
167 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  43.88 
 
 
136 aa  106  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  49.53 
 
 
167 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  48.54 
 
 
138 aa  105  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  45.95 
 
 
157 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  48.6 
 
 
166 aa  105  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  49.51 
 
 
142 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  49.51 
 
 
142 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  43.26 
 
 
161 aa  104  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  54.63 
 
 
141 aa  104  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  49.55 
 
 
135 aa  104  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  49.12 
 
 
133 aa  103  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  48.51 
 
 
141 aa  103  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  47.9 
 
 
176 aa  103  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  48.54 
 
 
172 aa  103  9e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  48.65 
 
 
135 aa  103  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  49.51 
 
 
163 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  47.83 
 
 
119 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  50.46 
 
 
175 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  45.9 
 
 
142 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  43.7 
 
 
138 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  48.65 
 
 
135 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  41.74 
 
 
134 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  48.54 
 
 
172 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  38.52 
 
 
157 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  44.62 
 
 
175 aa  100  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  42.99 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  48.08 
 
 
167 aa  98.6  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  46.03 
 
 
192 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  41.01 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  46.6 
 
 
187 aa  97.4  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  46.23 
 
 
166 aa  97.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  37.5 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  39.39 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  47.92 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  47.12 
 
 
186 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  46.85 
 
 
166 aa  95.5  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  44.44 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  39.71 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  47.12 
 
 
160 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  41.74 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  37.88 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  45.45 
 
 
158 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  40 
 
 
137 aa  94  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  45.19 
 
 
149 aa  93.6  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  51.58 
 
 
114 aa  93.6  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  51.58 
 
 
114 aa  93.6  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  45.37 
 
 
185 aa  93.6  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  42.02 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  37.88 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  35.1 
 
 
154 aa  92.8  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  44.86 
 
 
168 aa  93.2  1e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  42.48 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  42.28 
 
 
172 aa  93.2  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  42.59 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  49.06 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  40.68 
 
 
180 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  41.67 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  41.59 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  46.88 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  45.87 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  40.68 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  46.73 
 
 
173 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  42.73 
 
 
166 aa  91.7  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.621974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>