More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1336 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 125 aa  247  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  59.35 
 
 		 127 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  61.79 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  61.29 
 
 		 128 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  60.48 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 129 aa  157  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  60.48 
 
 		 128 aa  157  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  61.29 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  60.48 
 
 		 126 aa  157  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  58.87 
 
 		 124 aa  156  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  60.66 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 127 aa  154  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  56.91 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 125 aa  151  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  58.2 
 
 		 126 aa  151  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 125 aa  150  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  53.66 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 129 aa  147  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  54.84 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  55.83 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  60.8 
 
 		 125 aa  147  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  56.2 
 
 		 126 aa  147  6e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  52.03 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  55.83 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  50.81 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  53.23 
 
 		 126 aa  143  6e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 		 124 aa  144  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  50.82 
 
 		 151 aa  141  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 151 aa  140  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  50.41 
 
 		 148 aa  140  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 125 aa  140  8e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 124 aa  139  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 124 aa  137  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  48.8 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  51.24 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 		 124 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  51.97 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  51.97 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  51.97 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  51.97 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  51.97 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  51.97 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  51.97 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  51.97 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  54.33 
 
 		 128 aa  133  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 128 aa  133  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 128 aa  133  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  52.03 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  47.58 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>