297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1313 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  54.69 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
66 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  51.67 
 
 
69 aa  60.8  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  47.69 
 
 
66 aa  58.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0679  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000758197  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_657  ribosomal protein L35  40.91 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000644452  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  50 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  50.75 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  46.77 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  48.44 
 
 
66 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2595  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  53.9  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519025  hitchhiker  0.00116473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
66 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  48.44 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0767  ribosomal protein L35  46.97 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  46.15 
 
 
65 aa  52  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119658  ribosomal protein L35, chloroplast precursor  43.75 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  45.16 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  52  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  56.82 
 
 
66 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  51.52 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  51.52 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0189  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  52.27 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  52.27 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  52.27 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  41.54 
 
 
66 aa  50.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  45.31 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  52.27 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  45.16 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  43.48 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  43.75 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  43.55 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0068  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.5109  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  44.62 
 
 
66 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  41.94 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1883  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0659918  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  43.28 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1579  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  43.55 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>