84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1288 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  100 
 
 
401 aa  788    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  77.53 
 
 
403 aa  570  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  79.4 
 
 
400 aa  570  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  76.41 
 
 
491 aa  510  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  42.58 
 
 
629 aa  303  4.0000000000000003e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  41.35 
 
 
840 aa  266  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  44.48 
 
 
404 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  40.52 
 
 
626 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  37.82 
 
 
378 aa  246  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  39.47 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  50.19 
 
 
258 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  38.27 
 
 
417 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  35.42 
 
 
1131 aa  188  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  35.21 
 
 
553 aa  186  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  34.93 
 
 
559 aa  186  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  30.12 
 
 
528 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  30.41 
 
 
870 aa  180  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  35.15 
 
 
432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  33.66 
 
 
408 aa  171  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  32.93 
 
 
940 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  30.25 
 
 
481 aa  164  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  32.58 
 
 
410 aa  153  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  29.52 
 
 
502 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  47.29 
 
 
200 aa  149  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  32.03 
 
 
382 aa  146  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  29.97 
 
 
538 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  27.78 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  27.51 
 
 
501 aa  109  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  30.83 
 
 
938 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  29.04 
 
 
429 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.62 
 
 
769 aa  99.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  23.14 
 
 
708 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  25.66 
 
 
472 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  27.38 
 
 
463 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  27.11 
 
 
456 aa  96.3  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  28.37 
 
 
439 aa  93.2  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  28.03 
 
 
450 aa  93.2  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  25 
 
 
575 aa  92.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  33 
 
 
1287 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  28.43 
 
 
477 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  27.82 
 
 
471 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  27.27 
 
 
696 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  30.18 
 
 
714 aa  87  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  27.18 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  26.24 
 
 
2286 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  26.38 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0144  hypothetical protein  25.56 
 
 
368 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  22.9 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  26.09 
 
 
917 aa  80.9  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  26.97 
 
 
938 aa  77.8  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  28.15 
 
 
430 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  26.89 
 
 
1933 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  27.17 
 
 
3507 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  27.61 
 
 
4433 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  24.37 
 
 
480 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  27.41 
 
 
485 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  28.75 
 
 
2068 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.1 
 
 
2807 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  26.77 
 
 
669 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.09 
 
 
1272 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25.75 
 
 
1848 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  24.53 
 
 
688 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  22.76 
 
 
2864 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  23.24 
 
 
513 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  25.36 
 
 
2198 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  22.74 
 
 
889 aa  59.7  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1755  hypothetical protein  24.8 
 
 
529 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25.96 
 
 
1862 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.96 
 
 
1557 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  30.6 
 
 
460 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0939  hypothetical protein  27.4 
 
 
425 aa  53.5  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0324617  normal  0.305646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  24.43 
 
 
8871 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  26.06 
 
 
858 aa  50.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  20.54 
 
 
901 aa  49.7  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1367  hypothetical protein  22.14 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0144169  hitchhiker  0.000000182251 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0378  hypothetical protein  21.7 
 
 
440 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0579188  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6283  hypothetical protein  23.17 
 
 
421 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  23.5 
 
 
603 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0151  hypothetical protein  20.98 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  23.95 
 
 
1329 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  34.41 
 
 
553 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  26.79 
 
 
487 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1449  hypothetical protein  27.15 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2882  regulatory protein FlaEY  29.57 
 
 
950 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0301569  normal  0.06195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>