49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1268 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  100 
 
 		 414 aa  850    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  45.06 
 
 		 1132 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  44.12 
 
 		 1232 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  44.52 
 
 		 1032 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  47.07 
 
 		 408 aa  398  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  44.69 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  45.28 
 
 		 1089 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  43.77 
 
 		 1078 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  42.89 
 
 		 1161 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  41.36 
 
 		 1075 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  43.86 
 
 		 1089 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  42.08 
 
 		 1244 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  44.61 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  42.76 
 
 		 1082 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  43.69 
 
 		 1174 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  42.13 
 
 		 1001 aa  365  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  43.44 
 
 		 1033 aa  361  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  41.26 
 
 		 1156 aa  361  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  41.5 
 
 		 1124 aa  360  4e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  42.55 
 
 		 1062 aa  359  5e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  42.48 
 
 		 1050 aa  358  8e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  41.11 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  40.43 
 
 		 1127 aa  354  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  42.54 
 
 		 411 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  42.05 
 
 		 411 aa  352  5e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  39.95 
 
 		 1027 aa  350  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  42.79 
 
 		 1067 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  35.61 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  33.42 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  33 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  33.5 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  33 
 
 		 394 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  32.75 
 
 		 394 aa  189  7e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  32.85 
 
 		 424 aa  189  8e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 373 aa  182  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  32.49 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  31.7 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  29.38 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  32.21 
 
 		 392 aa  147  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  28.99 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  28.09 
 
 		 390 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  28.12 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  28.05 
 
 		 387 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  28.5 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  25.71 
 
 		 386 aa  110  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  27.27 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  27.03 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  26.9 
 
 		 397 aa  99.8  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  27.46 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>