More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1238 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 235 aa  477  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  43.56 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  45.26 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  43.23 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  44.44 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  44.68 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  44.24 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  40.17 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  41.89 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  38.1 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  41.44 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  44.7 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  44.2 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  43.11 
 
 		 229 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  44.14 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  38.91 
 
 		 262 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  38.46 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  39.67 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  43.61 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  39.19 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  37.22 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  41.33 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  43.66 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  41.33 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  40.62 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  36.77 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  39.91 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  37.56 
 
 		 271 aa  161  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  34.5 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  39.3 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  39.01 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  39.3 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  39.38 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  38.12 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  40.62 
 
 		 228 aa  158  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  38.29 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  38.26 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  41.67 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  36.68 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  37.23 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  41.41 
 
 		 199 aa  155  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  41.52 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  39.56 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  37.07 
 
 		 244 aa  154  9e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  41.89 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  39.83 
 
 		 240 aa  154  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  40.54 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  36.59 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  41.07 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  38.07 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  35.42 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  41.3 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  34.84 
 
 		 259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  38.43 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  38.3 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  37.44 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  42.66 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  39.11 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  38.57 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  34.22 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  43.22 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  38.84 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  37.56 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  34.8 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  37.56 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  34.43 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  35.75 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  36.16 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  42.57 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  37.33 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  36.94 
 
 		 223 aa  148  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  40.49 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  39.3 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  35.29 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  36.82 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  34.98 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1062  alanine racemase domain protein  38.69 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  36.61 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  38.12 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  35.27 
 
 		 261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  40.7 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  37.67 
 
 		 218 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  38.12 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  34.88 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  36.73 
 
 		 229 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  41.87 
 
 		 219 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  34.38 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  35.27 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  37.44 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  36.16 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  38.18 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  38.89 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  37.44 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.96 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  38.24 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  34.96 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  39.21 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  37.05 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>