More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1212 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1212  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.977984  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  38.57 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  37.2 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  35.02 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  37.2 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  34.72 
 
 		 283 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  33.46 
 
 		 303 aa  168  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1511  tRNA pseudouridine synthase B  35.64 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  36.02 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  31.86 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0071  tRNA pseudouridine synthase B  36.71 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.861563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0071  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  35.8 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  36.72 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  32.09 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  34.12 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  32.88 
 
 		 293 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09390  tRNA pseudouridine 55 synthase  35.16 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.86572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  31.91 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  36.44 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  34.88 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  32.42 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  32.12 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  36.95 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  32.77 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  32.54 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0361  tRNA pseudouridine synthase B  43.9 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.495035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  31.21 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  32.66 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2921  tRNA pseudouridine synthase B  33.91 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697495  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2695  tRNA pseudouridine synthase B  33.91 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  30.85 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  32.75 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  32.53 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  31.21 
 
 		 307 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  33.22 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3808  tRNA pseudouridine synthase B  34.68 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201981 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  33 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  30.85 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  30.85 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  31.21 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  32.76 
 
 		 342 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  32.02 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0441  tRNA pseudouridine synthase B  31.13 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  33.78 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  31.31 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  32.65 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  32.09 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  33.22 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  40.47 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  30.85 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  30.85 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  30.85 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  40.47 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0827  tRNA pseudouridine synthase B  35.18 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  32.97 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 		 299 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  32.01 
 
 		 318 aa  152  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  41.59 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  32.32 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  33.89 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0929  tRNA pseudouridine synthase B  31.54 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.590741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  30.85 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  32.13 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1447  tRNA pseudouridine synthase B  33.11 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000785982  normal  0.274975 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  33 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  39.17 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1807  tRNA pseudouridine synthase B  34.26 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.098308  normal  0.268652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  33.79 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  31.31 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  33.68 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  33.46 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  29.64 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  33.55 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  33.59 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  29.7 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0541  tRNA pseudouridine synthase B  31.97 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.578827  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  32.99 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  28.98 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  42.31 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4065  tRNA pseudouridine synthase B  31.56 
 
 		 310 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  32.21 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1313  pseudouridine synthase  31.69 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.702604  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1692  tRNA pseudouridine synthase B  34.04 
 
 		 305 aa  148  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  38.64 
 
 		 344 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  30 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1415  tRNA pseudouridine synthase B  32.09 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.334463  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1351  pseudouridine synthase  34.14 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.779318  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  29.67 
 
 		 315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2833  tRNA pseudouridine synthase B  35.94 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  32.27 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  31.08 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  32.07 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  32.43 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  30.41 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0629  tRNA pseudouridine synthase B  33.58 
 
 		 317 aa  146  3e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  30.17 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>