More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1168 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  100 
 
 
561 aa  1128    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  45.26 
 
 
871 aa  486  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  45.77 
 
 
553 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  46.25 
 
 
558 aa  484  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  43.88 
 
 
573 aa  480  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  45.66 
 
 
570 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  45.16 
 
 
558 aa  478  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  46.32 
 
 
553 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  42.7 
 
 
564 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  43.82 
 
 
564 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  44.58 
 
 
555 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  44.74 
 
 
561 aa  462  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  42.38 
 
 
787 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  43.95 
 
 
561 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  41.29 
 
 
556 aa  455  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  41.67 
 
 
563 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  41.73 
 
 
571 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  43.86 
 
 
553 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  41.94 
 
 
547 aa  451  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  41.76 
 
 
557 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.93 
 
 
571 aa  452  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  41.8 
 
 
553 aa  449  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  41.62 
 
 
567 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  40.39 
 
 
557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  42.73 
 
 
554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  42.83 
 
 
561 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  41.56 
 
 
565 aa  444  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  42.23 
 
 
571 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  42.17 
 
 
568 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  40.85 
 
 
568 aa  439  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  41.24 
 
 
589 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  41.17 
 
 
603 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  41.55 
 
 
558 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  41.17 
 
 
577 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  41.04 
 
 
599 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  41.22 
 
 
599 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  40.21 
 
 
594 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  40.91 
 
 
573 aa  438  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  39.89 
 
 
568 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.96 
 
 
568 aa  435  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  41.01 
 
 
599 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  41.16 
 
 
572 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  40.97 
 
 
562 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  39.47 
 
 
568 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  42 
 
 
559 aa  430  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.18 
 
 
568 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.18 
 
 
568 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  39.39 
 
 
566 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  39.18 
 
 
568 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.12 
 
 
568 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  40.07 
 
 
563 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  41.32 
 
 
570 aa  425  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.96 
 
 
568 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  40.04 
 
 
569 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.32 
 
 
563 aa  423  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.95 
 
 
568 aa  425  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.74 
 
 
568 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  40.04 
 
 
885 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.27 
 
 
568 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  41.95 
 
 
578 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  40.14 
 
 
637 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  42.4 
 
 
554 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  38.61 
 
 
561 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  39.82 
 
 
570 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  39.96 
 
 
582 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  42.26 
 
 
569 aa  413  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  39.86 
 
 
888 aa  413  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  38.46 
 
 
561 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  38.37 
 
 
577 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  38.5 
 
 
591 aa  412  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  39.6 
 
 
668 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  43.4 
 
 
520 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  37.9 
 
 
612 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  37.66 
 
 
670 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  39.86 
 
 
610 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1636  type II secretion system protein E  38.55 
 
 
673 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  42.8 
 
 
577 aa  405  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  39.58 
 
 
570 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  38.17 
 
 
577 aa  402  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  38.85 
 
 
891 aa  400  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1610  type II secretion system protein E  38.39 
 
 
673 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  40.04 
 
 
586 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  45.85 
 
 
514 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  38.74 
 
 
578 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  39.46 
 
 
575 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  44.56 
 
 
514 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  41.32 
 
 
563 aa  398  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  38.21 
 
 
574 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  39.43 
 
 
571 aa  395  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  36.62 
 
 
670 aa  395  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  41.1 
 
 
566 aa  393  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  39.38 
 
 
580 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  38.43 
 
 
560 aa  395  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  43.11 
 
 
520 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  38.67 
 
 
578 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  43.83 
 
 
518 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  37.12 
 
 
559 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  41.21 
 
 
520 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  37.16 
 
 
688 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  39.88 
 
 
585 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>