More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1128 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
648 aa  1313  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  41.65 
 
 
618 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  40.97 
 
 
806 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  41.02 
 
 
640 aa  446  1e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  40.69 
 
 
751 aa  447  1e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  40.07 
 
 
643 aa  441  1e-122  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  40.85 
 
 
640 aa  439  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  39.97 
 
 
643 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  38.96 
 
 
654 aa  433  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  39.97 
 
 
643 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  41.44 
 
 
730 aa  435  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  39.83 
 
 
625 aa  435  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  41.27 
 
 
763 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  40.46 
 
 
732 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  39.97 
 
 
734 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  38.87 
 
 
739 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  40.58 
 
 
833 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  39.9 
 
 
734 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  39.8 
 
 
770 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  38.67 
 
 
735 aa  419  1e-115  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  38.43 
 
 
811 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  39.14 
 
 
723 aa  415  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  39.19 
 
 
714 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  40.07 
 
 
728 aa  412  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  39.07 
 
 
714 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  37.15 
 
 
720 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  39.76 
 
 
757 aa  407  1e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  39.09 
 
 
727 aa  406  1e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  39.49 
 
 
712 aa  407  1e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  37.72 
 
 
720 aa  408  1e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  39.83 
 
 
728 aa  407  1e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  38.23 
 
 
727 aa  408  1e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  39.61 
 
 
776 aa  407  1e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  37.48 
 
 
646 aa  405  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.46416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  40 
 
 
712 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  39.14 
 
 
779 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  38.82 
 
 
661 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  39.07 
 
 
776 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  39.59 
 
 
824 aa  402  1e-110  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  40 
 
 
750 aa  400  1e-110  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  40.18 
 
 
824 aa  400  1e-110  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  37.83 
 
 
741 aa  401  1e-110  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  37.82 
 
 
691 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  34.65 
 
 
713 aa  393  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  38.46 
 
 
755 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  37.5 
 
 
718 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  37.16 
 
 
681 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.86 
 
 
765 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  36.11 
 
 
774 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  38.53 
 
 
667 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.45418e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  36.91 
 
 
775 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21042e-11 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  36.32 
 
 
761 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  36.42 
 
 
727 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  38.79 
 
 
796 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  37.15 
 
 
905 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  36.88 
 
 
768 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  38.55 
 
 
648 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  37.1 
 
 
662 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  35.29 
 
 
750 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  37.68 
 
 
693 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.43648e-11  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  37.42 
 
 
683 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  36.74 
 
 
704 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  36.49 
 
 
759 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  33.23 
 
 
759 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  34.71 
 
 
757 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  38.1 
 
 
761 aa  375  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  38.45 
 
 
810 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  39.28 
 
 
709 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  36.92 
 
 
669 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  37.39 
 
 
656 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  35.56 
 
 
742 aa  372  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  35.48 
 
 
750 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  37.07 
 
 
683 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  34.62 
 
 
769 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  36.81 
 
 
752 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  37.79 
 
 
649 aa  366  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  36.4 
 
 
712 aa  369  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  35.89 
 
 
714 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  36.77 
 
 
626 aa  364  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  40.43 
 
 
654 aa  364  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  34.83 
 
 
724 aa  364  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  35.49 
 
 
642 aa  365  2e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  36.69 
 
 
828 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  37.75 
 
 
656 aa  365  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  35.1 
 
 
760 aa  363  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  35.12 
 
 
668 aa  363  5e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  34.83 
 
 
718 aa  363  5e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  34.95 
 
 
762 aa  363  6e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  35.49 
 
 
708 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  35.88 
 
 
730 aa  361  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  1.13999e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  36.81 
 
 
683 aa  361  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  36.81 
 
 
683 aa  361  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  34.31 
 
 
758 aa  361  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  34.83 
 
 
642 aa  360  4e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  36.63 
 
 
683 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  38.64 
 
 
751 aa  360  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  38.1 
 
 
727 aa  360  6e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  36.81 
 
 
683 aa  359  8e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  38.33 
 
 
658 aa  359  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  37.39 
 
 
680 aa  359  9e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>