151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1114 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1114  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 
74 aa  150  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00330778  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  47.22 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11009  serine rich protein  42.65 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.667745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  45.95 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  44.26 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  51.79 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  46.38 
 
 
71 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  41.67 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  41.67 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  39.13 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1094  FmdB transcriptional regulator  44.74 
 
 
89 aa  67  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  50 
 
 
137 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  43.75 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  51.79 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  40.28 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  50 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  46.43 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  45.59 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  41.1 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  44.93 
 
 
75 aa  63.5  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  40.62 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0908  regulatory protein, FmdB family  50.91 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3034  FmdB family regulatory protein  43.48 
 
 
84 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773747  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  44.44 
 
 
128 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1970  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  44.83 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  44.64 
 
 
101 aa  62  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  40.62 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  42.42 
 
 
81 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  40.62 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  44.64 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0029  FmdB family regulatory protein  45.45 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  43.48 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  40.62 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  44.64 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  43.1 
 
 
86 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  36.11 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1411  regulatory protein, FmdB family  43.1 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23900  putative regulatory protein, FmdB family  46.43 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1895  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 
117 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.448819  normal  0.145207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  43.28 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  37.88 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0781  FmdB family regulatory protein  40.54 
 
 
75 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000492398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0804  FmdB family regulatory protein  40.54 
 
 
75 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000263979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  42.25 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3191  FmdB family regulatory protein  52.83 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  45.9 
 
 
101 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2140  FmdB family regulatory protein  44.26 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  41.07 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16440  putative regulatory protein, FmdB family  41.07 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32690  putative regulatory protein, FmdB family  40 
 
 
112 aa  57  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.914233  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2815  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.640652  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  39.44 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  40.85 
 
 
85 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  33.82 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  34.78 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  34.78 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6324  regulatory protein, FmdB family  38.1 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165247  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  31.51 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  39.06 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  41.67 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0277  FmdB family regulatory protein  40.58 
 
 
69 aa  55.1  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000770488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  42.11 
 
 
88 aa  55.1  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  39.06 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  39.06 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2465  regulatory protein, FmdB family  35.82 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0532528  hitchhiker  0.00128388 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  36.62 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  38.27 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  39.47 
 
 
89 aa  53.9  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0875  regulatory protein, FmdB family  41.38 
 
 
113 aa  53.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2923  regulatory protein, FmdB family  38.03 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  35.14 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  34.29 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  35.59 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  34.29 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0213  FmdB family regulatory protein  39.06 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  34.67 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  37.1 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  35.38 
 
 
105 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  40.35 
 
 
82 aa  50.8  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  43.55 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  33.82 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  41.43 
 
 
81 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  40.68 
 
 
92 aa  50.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  33.33 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1295  hypothetical protein  33.9 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  29.41 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  38.46 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0708  FmdB family regulatory protein  39.29 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.001557  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  30.56 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  29.17 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  28.77 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  32.43 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  32.43 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>