250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1106 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
93 aa  180  5e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  45.24 
 
 
88 aa  70.1  1e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.91631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  46.84 
 
 
88 aa  69.3  2e-11  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  47.31 
 
 
99 aa  68.9  2e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  44.44 
 
 
95 aa  68.2  3e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  39 
 
 
99 aa  67.4  6e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  44.33 
 
 
97 aa  67  9e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  42.71 
 
 
98 aa  65.5  2e-10  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
116 aa  64.3  5e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  45.88 
 
 
87 aa  64.3  6e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 
87 aa  63.9  7e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 
87 aa  63.9  7e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  44.94 
 
 
91 aa  63.9  8e-10  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 
94 aa  63.9  8e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.34662e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  41.18 
 
 
88 aa  62.4  2e-09  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  7.87873e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  44.16 
 
 
92 aa  62.8  2e-09  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  5.36683e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 
88 aa  62.4  2e-09  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
97 aa  61.6  3e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0847  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 
97 aa  61.6  3e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 
89 aa  61.6  4e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.40091e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  37.23 
 
 
112 aa  61.2  4e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 
88 aa  61.2  4e-09  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  40.48 
 
 
86 aa  60.8  6e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
86 aa  60.5  7e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  34.02 
 
 
97 aa  60.8  7e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  34.02 
 
 
97 aa  60.8  7e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  47.19 
 
 
115 aa  60.5  8e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  5.62255e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  42.35 
 
 
88 aa  60.5  9e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
85 aa  59.7  1e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
85 aa  59.7  1e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.15322e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
85 aa  59.7  1e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53456e-13 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
85 aa  59.7  1e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
85 aa  59.7  1e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  40.45 
 
 
89 aa  60.1  1e-08  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
85 aa  59.7  1e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
85 aa  59.7  1e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
85 aa  59.7  1e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.91712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
85 aa  59.7  1e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  39.76 
 
 
90 aa  58.9  2e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 
88 aa  59.3  2e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 
87 aa  58.9  2e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31209e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
85 aa  59.3  2e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  40.96 
 
 
88 aa  58.5  3e-08  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  58.5  3e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  1.17943e-11 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
89 aa  58.2  4e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01050  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 
82 aa  58.2  4e-08  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  40 
 
 
88 aa  58.2  4e-08  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 
85 aa  57.8  5e-08  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 
87 aa  57.8  5e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.04078e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  38.27 
 
 
100 aa  57.4  6e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 
87 aa  57  8e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  42.71 
 
 
97 aa  57  8e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  34.18 
 
 
92 aa  57  9e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0947  ribosomal protein S20  44.05 
 
 
97 aa  57  9e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.351712 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  40 
 
 
105 aa  56.6  1e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  40 
 
 
86 aa  56.6  1e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 
91 aa  57  1e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  5.03412e-05 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  40 
 
 
86 aa  56.6  1e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  40 
 
 
86 aa  56.6  1e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
97 aa  56.6  1e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  39.29 
 
 
88 aa  55.5  2e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 
94 aa  55.8  2e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  1.7573e-05 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 
90 aa  55.8  2e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.59944e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  43.53 
 
 
85 aa  55.8  2e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.76977e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1129  ribosomal protein S20  40 
 
 
93 aa  55.5  2e-07  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 
100 aa  55.5  2e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
97 aa  56.2  2e-07  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  40.66 
 
 
96 aa  55.1  3e-07  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  3.00859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 
91 aa  55.1  3e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  38.1 
 
 
88 aa  55.1  3e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 
95 aa  55.1  3e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  36.9 
 
 
87 aa  54.3  5e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 
90 aa  54.3  6e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 
86 aa  53.9  7e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
87 aa  53.9  7e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  35.44 
 
 
88 aa  53.9  7e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 
91 aa  53.9  8e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  38.82 
 
 
92 aa  53.9  8e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 
91 aa  53.9  8e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 
88 aa  53.5  8e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1384  ribosomal protein S20  45 
 
 
100 aa  53.9  8e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
98 aa  53.1  1e-06  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
98 aa  52.8  1e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 
90 aa  53.1  1e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.26326e-09  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
87 aa  53.1  1e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.8734e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 
92 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
87 aa  53.1  1e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.71927e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 
84 aa  53.1  1e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  36.47 
 
 
86 aa  53.1  1e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  37.66 
 
 
151 aa  53.1  1e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
98 aa  52.8  1e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2301  ribosomal protein S20  37.08 
 
 
88 aa  52.4  2e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62768  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 
86 aa  52.8  2e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  40.96 
 
 
89 aa  52.4  2e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 
90 aa  52.4  2e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  38.1 
 
 
88 aa  52.8  2e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  37.97 
 
 
92 aa  52.4  2e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 
92 aa  52.4  2e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1710  30S ribosomal protein S20  40 
 
 
89 aa  52.4  2e-06  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  3.12483e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
87 aa  52  3e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>