More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1083 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1083  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 474 aa  946    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000288858  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  56.05 
 
 		 492 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  55.65 
 
 		 450 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  56.89 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  54.66 
 
 		 436 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  63.66 
 
 		 642 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  53.8 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  54.22 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  63.06 
 
 		 445 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  53.35 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  63.06 
 
 		 444 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  53.55 
 
 		 420 aa  467  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  49.13 
 
 		 518 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  53.35 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  52.92 
 
 		 423 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  53.13 
 
 		 423 aa  465  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  53.13 
 
 		 423 aa  465  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  52.92 
 
 		 423 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  52.92 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  62.06 
 
 		 423 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 573 aa  461  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  53.13 
 
 		 423 aa  465  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  55.34 
 
 		 437 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  52.92 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  53.13 
 
 		 423 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  62.43 
 
 		 415 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  62.64 
 
 		 498 aa  459  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  51.08 
 
 		 425 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3070  transcription termination factor Rho  58.29 
 
 		 615 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581675  hitchhiker  0.00476927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  51.07 
 
 		 416 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  62.95 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  53.15 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  58.79 
 
 		 497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0978  transcription termination factor Rho  61.92 
 
 		 423 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000458631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  61.77 
 
 		 653 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  58.22 
 
 		 429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  51.96 
 
 		 434 aa  451  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  58.7 
 
 		 548 aa  449  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  57.44 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  58.04 
 
 		 415 aa  448  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  55.39 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  55.39 
 
 		 415 aa  448  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0443  transcription termination factor Rho  56.06 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0265285  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  60.11 
 
 		 422 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  59.13 
 
 		 414 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 602 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  59.56 
 
 		 414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0679  transcription termination factor Rho  58.09 
 
 		 439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000809271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  57.59 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  58.76 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  53.3 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  50.54 
 
 		 421 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0264  transcription termination factor Rho  60.61 
 
 		 512 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  50.32 
 
 		 437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  58.68 
 
 		 415 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  55.15 
 
 		 415 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  58.68 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  62.26 
 
 		 508 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  58.58 
 
 		 415 aa  443  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1005  transcription termination factor Rho  57.59 
 
 		 576 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  50.32 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  61.39 
 
 		 690 aa  445  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2038  transcription termination factor Rho  62.81 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0991025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  50.87 
 
 		 421 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  58.36 
 
 		 437 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  50.11 
 
 		 421 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  59.18 
 
 		 421 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  50.54 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  59.45 
 
 		 421 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  56.14 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  57.72 
 
 		 421 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  53.68 
 
 		 415 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0726  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 417 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2532  transcription termination factor Rho  58.65 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  59.18 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0605  transcription termination factor Rho  57.57 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000783157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  59.04 
 
 		 605 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  58.9 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0459  transcription termination factor Rho  56.45 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  56.4 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0725  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 417 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  52.86 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  49.68 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1393  transcription termination factor Rho  57.92 
 
 		 423 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.107129  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1344  transcription termination factor Rho  58.29 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000288127  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  56.64 
 
 		 418 aa  438  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  58.63 
 
 		 421 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  61 
 
 		 676 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1421  transcription termination factor Rho  58.38 
 
 		 444 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  54.09 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  59.19 
 
 		 422 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0281  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 422 aa  436  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.697975  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0778  transcription termination factor Rho  57.97 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0471  transcription termination factor Rho  58.11 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  57.77 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  60.22 
 
 		 438 aa  438  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  58.27 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1553  transcription termination factor Rho  59.03 
 
 		 447 aa  436  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000288549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  57.77 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  58.36 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>