More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1003 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1003  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 83 aa  168  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000130105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  73.91 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  72.6 
 
 		 73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 73 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  107  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 75 aa  107  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  69.86 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 73 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  69.12 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  65.75 
 
 		 72 aa  103  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1115  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000159264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  65.75 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2596  translation initiation factor IF-1  65.22 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0656531  normal  0.651442 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  65.75 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  65.75 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  64.18 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2207  translation initiation factor IF-1  64.18 
 
 		 72 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268658  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 		 73 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  64.38 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  62.67 
 
 		 73 aa  101  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  62.67 
 
 		 73 aa  101  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  65.75 
 
 		 73 aa  101  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  68.66 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  62.67 
 
 		 73 aa  101  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  64.38 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0311  translation initiation factor IF-1  64.18 
 
 		 72 aa  100  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252323  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  65.75 
 
 		 72 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  69.23 
 
 		 73 aa  100  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  64.38 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  64.38 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  67.12 
 
 		 73 aa  100  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  65.75 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  64.38 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  65.67 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1552  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 73 aa  100  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 73 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1829  translation initiation factor IF-1  62.69 
 
 		 72 aa  100  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  65.75 
 
 		 72 aa  100  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0268  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 78 aa  99.4  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  64.18 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1012  translation initiation factor IF-1  68.66 
 
 		 72 aa  99.4  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631834  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  65.67 
 
 		 72 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  62.34 
 
 		 75 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  99.4  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  65.75 
 
 		 73 aa  99.8  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  62.34 
 
 		 75 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  65.75 
 
 		 73 aa  99.4  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1755  translation initiation factor IF-1  68.66 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0524428  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0976  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.844523  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2884  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  98.6  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  61.84 
 
 		 74 aa  98.6  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  65.75 
 
 		 73 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0609  translation initiation factor IF-1  65.75 
 
 		 73 aa  99.4  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1371  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1315  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000270736  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2992  translation initiation factor IF-1  61.84 
 
 		 74 aa  98.6  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0209  translation initiation factor IF-1  68.66 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0055  translation initiation factor IF-1  68.66 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  61.84 
 
 		 74 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  65.75 
 
 		 73 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  61.84 
 
 		 74 aa  98.6  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4936  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 73 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000594516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  64.18 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0090  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.146045  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3117  translation initiation factor IF-1  64.38 
 
 		 73 aa  98.2  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  70.31 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0217  translation initiation factor IF-1  65.67 
 
 		 71 aa  98.2  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.425198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 73 aa  98.2  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  64.38 
 
 		 73 aa  98.6  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1944  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  98.2  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.25939  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1762  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  98.2  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  63.01 
 
 		 72 aa  98.2  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1578  translation initiation factor IF-1  67.16 
 
 		 72 aa  98.2  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2401  translation initiation factor IF-1  61.19 
 
 		 72 aa  97.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000518496  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  65.67 
 
 		 83 aa  97.4  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0864  translation initiation factor IF-1  72.13 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.177716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>