More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1000 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 419 aa  823    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  48.82 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  47.52 
 
 		 418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  47.16 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  48.48 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  46.93 
 
 		 421 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  47.65 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  48.11 
 
 		 419 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  46.73 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  48.7 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  43.29 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  46.3 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  48.47 
 
 		 422 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  47.67 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  45.95 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  44.69 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  43.06 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  42.36 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  46.82 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  45.01 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  42.17 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  45.09 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  43.47 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  49.07 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  43.76 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  43.79 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  43.79 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  41.44 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  43.6 
 
 		 447 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  44.94 
 
 		 430 aa  362  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  46.38 
 
 		 436 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  43.6 
 
 		 447 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  46.68 
 
 		 448 aa  362  7.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  44.73 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  43.21 
 
 		 437 aa  360  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1312  preprotein translocase subunit SecY  45.24 
 
 		 431 aa  358  7e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000457849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  46.15 
 
 		 436 aa  358  9e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  43.63 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  43.63 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.09 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  41.81 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  43.2 
 
 		 447 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  44.27 
 
 		 430 aa  355  6.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  43.21 
 
 		 441 aa  355  8.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  42.83 
 
 		 438 aa  355  8.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.93 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  44.12 
 
 		 437 aa  354  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  43.42 
 
 		 442 aa  353  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  40.89 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  42.98 
 
 		 441 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2599  preprotein translocase subunit SecY  44.65 
 
 		 440 aa  353  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0785292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  43.74 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  44.39 
 
 		 441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  41.16 
 
 		 443 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  42.69 
 
 		 441 aa  352  8e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.71 
 
 		 442 aa  352  8.999999999999999e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  41.39 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  44.67 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  44.92 
 
 		 435 aa  350  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  42.76 
 
 		 437 aa  349  4e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  44.02 
 
 		 432 aa  349  7e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  42 
 
 		 448 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  42.12 
 
 		 443 aa  344  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  43.82 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.57 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  44.22 
 
 		 445 aa  341  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  40.65 
 
 		 437 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 		 443 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  43.58 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  42 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  42.15 
 
 		 441 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  43.88 
 
 		 429 aa  340  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  42.44 
 
 		 446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0285  preprotein translocase subunit SecY  42.19 
 
 		 430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000550268  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  41.2 
 
 		 441 aa  339  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  41.96 
 
 		 430 aa  339  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 		 442 aa  339  5e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.49 
 
 		 427 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.12 
 
 		 428 aa  339  7e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  41.82 
 
 		 427 aa  338  8e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  40.67 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  43.44 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  42.34 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  44.29 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1310  preprotein translocase subunit SecY  41.88 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1847  preprotein translocase subunit SecY  43.09 
 
 		 441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838745  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  41.63 
 
 		 446 aa  336  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  42.62 
 
 		 435 aa  336  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1053  preprotein translocase, SecY subunit  44.22 
 
 		 449 aa  335  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.615544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  41.55 
 
 		 446 aa  335  7.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2214  preprotein translocase subunit SecY  41.82 
 
 		 439 aa  335  7.999999999999999e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.180024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  42.12 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  41.9 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0271  preprotein translocase, SecY subunit  44.57 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.523157  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0231  preprotein translocase subunit SecY  43.66 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.832784  normal  0.264762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0234  preprotein translocase subunit SecY  43.66 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  41.39 
 
 		 446 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  40.27 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>