More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0981 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  58.54 
 
 		 209 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 		 211 aa  238  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  55.83 
 
 		 211 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  55.34 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  55.29 
 
 		 207 aa  228  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  55.29 
 
 		 207 aa  228  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 209 aa  228  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 		 209 aa  227  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  57.97 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 		 212 aa  225  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  56.5 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  55 
 
 		 209 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 		 211 aa  221  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  51.18 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 213 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 212 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 212 aa  205  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  51.38 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 212 aa  204  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  50 
 
 		 217 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000163613  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 208 aa  201  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 216 aa  201  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  48.22 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  51.83 
 
 		 220 aa  201  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  47.6 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  47.85 
 
 		 214 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0192  ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  49.28 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  51.38 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  50.23 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  49.01 
 
 		 209 aa  197  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  50.7 
 
 		 216 aa  197  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  48.31 
 
 		 222 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 214 aa  197  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 213 aa  195  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  194  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 212 aa  194  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 204 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  46.38 
 
 		 211 aa  193  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  46.12 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 211 aa  193  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 		 219 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  45.75 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0291  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0279726  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  45.97 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  45.02 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  50.73 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 213 aa  188  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  46.19 
 
 		 247 aa  188  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  45.59 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  45.63 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  45.32 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  46.31 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  45.81 
 
 		 218 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0226  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.00275796  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  48.02 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  43.6 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  43.6 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>