More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0980 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0980  ribosomal protein S10  100 
 
 		 106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.604539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 102 aa  150  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  65.35 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  69.31 
 
 		 103 aa  147  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  68 
 
 		 123 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  65.35 
 
 		 102 aa  144  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 		 103 aa  143  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 103 aa  141  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  64.36 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  63.37 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4316  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 		 102 aa  140  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318544 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 103 aa  140  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 103 aa  140  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 103 aa  140  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 103 aa  140  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4277  ribosomal protein S10  63 
 
 		 103 aa  140  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000346918  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 103 aa  140  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3924  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 		 102 aa  140  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 103 aa  140  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 102 aa  140  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3805  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00677019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3747  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016598  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2633  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000272648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 		 105 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3477  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000483294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3446  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122515  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0319  30S ribosomal protein S10  61.9 
 
 		 106 aa  140  5e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3170  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0248  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127153  normal  0.202124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2760  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000915461  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0266  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00303963  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 		 102 aa  140  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000312385  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  62.38 
 
 		 102 aa  140  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16301  30S ribosomal protein S10  61.9 
 
 		 106 aa  140  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  62 
 
 		 104 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 		 102 aa  140  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 		 102 aa  140  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  59.41 
 
 		 103 aa  140  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1073  30S ribosomal protein S10  61.9 
 
 		 106 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2023  30S ribosomal protein S10  61.9 
 
 		 106 aa  140  8e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.532021  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19481  30S ribosomal protein S10  61.9 
 
 		 106 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2841  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  139  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000513436  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3645  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  139  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000475308  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0313  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  139  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000233009  normal  0.0207604 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16871  30S ribosomal protein S10  61.9 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  66.33 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1599  30S ribosomal protein S10  61.9 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  62.63 
 
 		 104 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0874  ribosomal protein S10  61 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.522199  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 		 102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0420  SSU ribosomal protein S10P  61.39 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00124832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 		 102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  64.29 
 
 		 107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0048  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 		 105 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  60.61 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 		 102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 102 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 		 102 aa  138  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17101  30S ribosomal protein S10  60.95 
 
 		 106 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3339  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16981  30S ribosomal protein S10  60.95 
 
 		 106 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 		 102 aa  137  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 		 102 aa  137  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1263  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0052  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4916  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 		 104 aa  137  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0255  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 		 104 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000004332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 104 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0202  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 		 104 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  64.29 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0477  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 105 aa  137  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0395283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0476  ribosomal protein S10  62 
 
 		 108 aa  137  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0718  30S ribosomal protein S10  61 
 
 		 103 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000141431  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23661  30S ribosomal protein S10  60.95 
 
 		 106 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.09836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 102 aa  137  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 103 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>