More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0976 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  100 
 
 
128 aa  256  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  84 
 
 
135 aa  213  5e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  84.43 
 
 
134 aa  212  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 
123 aa  209  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  83.87 
 
 
124 aa  208  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  80.95 
 
 
135 aa  208  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 
125 aa  207  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 
124 aa  207  4e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  77.14 
 
 
140 aa  207  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  88.71 
 
 
127 aa  206  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000777743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  88.71 
 
 
127 aa  206  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000381794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 
124 aa  205  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 
123 aa  206  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  82.93 
 
 
123 aa  206  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000946839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 
124 aa  206  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 
123 aa  204  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 
133 aa  204  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 
123 aa  202  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  80.33 
 
 
123 aa  202  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 
124 aa  202  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 
124 aa  201  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  79.67 
 
 
123 aa  202  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  76.8 
 
 
126 aa  201  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 
124 aa  201  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
123 aa  201  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  77.95 
 
 
127 aa  201  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  77.78 
 
 
136 aa  200  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  75.91 
 
 
137 aa  200  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  200  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
123 aa  200  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
124 aa  200  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
123 aa  200  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  85.37 
 
 
123 aa  200  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 
123 aa  200  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  75.18 
 
 
145 aa  199  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 
123 aa  200  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  200  7e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 
123 aa  200  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  77.95 
 
 
127 aa  199  8e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
123 aa  199  9e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  74.29 
 
 
140 aa  199  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  77.42 
 
 
124 aa  199  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
124 aa  199  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
123 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 
124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  74.29 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  74.29 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  74.29 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  73.57 
 
 
140 aa  197  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  73.57 
 
 
140 aa  197  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  73.57 
 
 
140 aa  197  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  73.57 
 
 
140 aa  197  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  73.57 
 
 
140 aa  197  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  73.57 
 
 
140 aa  197  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  73.57 
 
 
140 aa  197  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  197  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  79.2 
 
 
134 aa  197  3.9999999999999996e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  76.56 
 
 
128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0102  30S ribosomal protein S12  78.63 
 
 
140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 
126 aa  197  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 
126 aa  197  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  77.42 
 
 
124 aa  197  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 
124 aa  197  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  75.78 
 
 
128 aa  197  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  77.6 
 
 
125 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  77.6 
 
 
125 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  72.66 
 
 
142 aa  196  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  196  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  196  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  80 
 
 
137 aa  196  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 
123 aa  196  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 
124 aa  196  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  80 
 
 
142 aa  196  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0568  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 
137 aa  196  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000132236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0582  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 
137 aa  196  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0186  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 
137 aa  196  9e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000101911  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  77.24 
 
 
123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 
123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0557  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 
124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.563691  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2823  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
123 aa  194  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0494947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  79.2 
 
 
137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
125 aa  194  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0308  30S ribosomal protein S12  77.95 
 
 
127 aa  194  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000773303  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  76.86 
 
 
122 aa  194  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 
124 aa  194  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  76 
 
 
125 aa  194  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  79.2 
 
 
135 aa  194  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  75.2 
 
 
125 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  75.2 
 
 
126 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  77.17 
 
 
127 aa  193  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
125 aa  193  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 
125 aa  194  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  75.61 
 
 
123 aa  193  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  75.2 
 
 
126 aa  193  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2962  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 
123 aa  193  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.330049  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  75.4 
 
 
135 aa  193  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  71.94 
 
 
140 aa  193  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>