More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0873 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  100 
 
 
871 aa  1733    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  51.8 
 
 
553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  51.5 
 
 
558 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  50.63 
 
 
553 aa  551  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  51.37 
 
 
558 aa  552  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  49.65 
 
 
557 aa  543  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  50.45 
 
 
556 aa  545  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  48.66 
 
 
555 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  48.22 
 
 
557 aa  528  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  46.56 
 
 
573 aa  524  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  47.87 
 
 
561 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  46.26 
 
 
787 aa  525  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  48.02 
 
 
563 aa  521  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  47.9 
 
 
570 aa  520  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  46.87 
 
 
561 aa  520  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  47.02 
 
 
571 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  47.13 
 
 
553 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  45.63 
 
 
564 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  47.56 
 
 
599 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  47.39 
 
 
603 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  46.95 
 
 
553 aa  512  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  47.39 
 
 
599 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  36.33 
 
 
885 aa  511  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  47.7 
 
 
571 aa  510  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  46.54 
 
 
561 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  47.99 
 
 
599 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.48 
 
 
563 aa  504  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  45.68 
 
 
564 aa  506  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.41 
 
 
568 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  45.21 
 
 
568 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.78 
 
 
568 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.04 
 
 
568 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  45.66 
 
 
558 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  45 
 
 
888 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  45.85 
 
 
565 aa  494  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.17 
 
 
571 aa  495  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  44.97 
 
 
567 aa  491  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  45.73 
 
 
577 aa  492  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.89 
 
 
568 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  46.62 
 
 
573 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.68 
 
 
568 aa  488  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  43.89 
 
 
591 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  44.68 
 
 
568 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.86 
 
 
568 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  49.03 
 
 
520 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  45.26 
 
 
561 aa  486  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  44.86 
 
 
568 aa  485  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  46.98 
 
 
568 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  47.57 
 
 
559 aa  484  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.56 
 
 
568 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  44.23 
 
 
566 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  46.36 
 
 
563 aa  482  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.72 
 
 
568 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  48.16 
 
 
520 aa  479  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  43.16 
 
 
554 aa  476  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  43.83 
 
 
589 aa  478  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  48.16 
 
 
520 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  43.73 
 
 
576 aa  474  1e-132  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  42.96 
 
 
891 aa  473  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  44.27 
 
 
570 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  43.72 
 
 
577 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  44.8 
 
 
576 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  46.11 
 
 
569 aa  468  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  43.97 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  44.32 
 
 
580 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  46.91 
 
 
520 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  44.09 
 
 
572 aa  463  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  46.62 
 
 
521 aa  466  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  40.39 
 
 
568 aa  462  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  47.72 
 
 
503 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  41.53 
 
 
577 aa  462  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.84 
 
 
571 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  42.96 
 
 
570 aa  462  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  42.98 
 
 
578 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  46.56 
 
 
566 aa  458  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  41.94 
 
 
570 aa  458  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  43.67 
 
 
563 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  43.92 
 
 
573 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  43.12 
 
 
610 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  43.39 
 
 
573 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  45.76 
 
 
567 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  42.46 
 
 
578 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  43.67 
 
 
562 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  47.48 
 
 
499 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  43.4 
 
 
574 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  43.95 
 
 
571 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.67 
 
 
569 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  42.86 
 
 
594 aa  452  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  48.83 
 
 
501 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.49 
 
 
569 aa  452  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  43.19 
 
 
571 aa  451  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  42.93 
 
 
585 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  42.61 
 
 
575 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  41.29 
 
 
569 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.14 
 
 
569 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  48.61 
 
 
500 aa  449  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  42.05 
 
 
577 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  40.5 
 
 
561 aa  449  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  44.01 
 
 
583 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  44.42 
 
 
554 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>