266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0867 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
200 aa  400  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.21 
 
 
2401 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
265 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.92 
 
 
557 aa  57  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 
326 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.54 
 
 
762 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  26.54 
 
 
762 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
927 aa  55.1  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  33.33 
 
 
574 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3428  TPR domain-containing protein  28.8 
 
 
399 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  31.93 
 
 
340 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
828 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.57 
 
 
571 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
399 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0523  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
302 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.15246  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1244  TPR domain-containing protein  26.67 
 
 
658 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 
1034 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  31.95 
 
 
266 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  27.22 
 
 
577 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 
1104 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  27.15 
 
 
174 aa  52.4  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
351 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
1005 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.01 
 
 
267 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.48 
 
 
364 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
722 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  33.67 
 
 
575 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
556 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 
670 aa  51.6  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  26.11 
 
 
577 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.55 
 
 
795 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
808 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.1 
 
 
358 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  27.69 
 
 
614 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.73 
 
 
2240 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 
563 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
351 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  28.23 
 
 
937 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
1127 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
265 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 
293 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31.18 
 
 
695 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
566 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.53 
 
 
884 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  26.71 
 
 
503 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  26.92 
 
 
734 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 
762 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 
573 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
781 aa  48.9  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
203 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
573 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
362 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  25.29 
 
 
729 aa  48.5  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
402 aa  48.5  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.13 
 
 
352 aa  48.5  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
595 aa  48.5  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
527 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
573 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  31.52 
 
 
473 aa  48.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0993  putative lipoprotein  25.37 
 
 
477 aa  48.1  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0358933  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4639  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 
311 aa  48.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  25.62 
 
 
864 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3412  diguanylate cyclase with TPR repeats  28.38 
 
 
816 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.18 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0650389  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
870 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 
1038 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
575 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
566 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0829  tetratricopeptide TPR_2  37.14 
 
 
394 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.89 
 
 
1486 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 
505 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  22.31 
 
 
389 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
573 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
323 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.9 
 
 
708 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 
4079 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.02 
 
 
1979 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
686 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.74 
 
 
265 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 
748 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2882  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.28 
 
 
767 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
1737 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  26.19 
 
 
955 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  24.26 
 
 
1133 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 
364 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
1714 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  24.32 
 
 
272 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 
546 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  28.03 
 
 
625 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 
866 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  22.99 
 
 
1154 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.6 
 
 
624 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3387  TPR domain protein  24.85 
 
 
304 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
568 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.56 
 
 
553 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 
572 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3236  tetratricopeptide TPR_4  27.73 
 
 
514 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.789976  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
879 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  30.34 
 
 
673 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>