270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0864 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
396 aa  793    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  32.23 
 
 
390 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  30.87 
 
 
399 aa  179  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  32.74 
 
 
390 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  29.27 
 
 
386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  31.47 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  30.69 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 
375 aa  157  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  29.95 
 
 
391 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  27.71 
 
 
416 aa  156  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  30.29 
 
 
392 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  28.84 
 
 
382 aa  145  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 
408 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 
391 aa  133  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 
386 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  26.56 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  28.38 
 
 
396 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  27.83 
 
 
341 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  26.48 
 
 
406 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  28 
 
 
376 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  27.97 
 
 
378 aa  122  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.98 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  26.55 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.82 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 
407 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  24.87 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  26.3 
 
 
379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  29.25 
 
 
402 aa  110  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  26.48 
 
 
402 aa  110  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  27.46 
 
 
399 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  27.46 
 
 
385 aa  106  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 
393 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  24.21 
 
 
365 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 
398 aa  103  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  24.66 
 
 
381 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  27.24 
 
 
369 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 
398 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 
384 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  25.21 
 
 
379 aa  99.8  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  24.4 
 
 
421 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  23.65 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  26.94 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 
368 aa  97.4  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  24.6 
 
 
394 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  24.6 
 
 
394 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  22.87 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  23.42 
 
 
360 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  25.49 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 
360 aa  90.5  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  25.31 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.86 
 
 
446 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  24.1 
 
 
385 aa  86.3  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  21.7 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.39 
 
 
445 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  24.06 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.29 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  25.25 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.5 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 
394 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  26.22 
 
 
443 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  24.05 
 
 
418 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.16 
 
 
449 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 
380 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  24.22 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.22 
 
 
443 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  24.76 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  24.63 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  21.61 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.23 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.2 
 
 
387 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  24.67 
 
 
362 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  24.33 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.81 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  24.33 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  23.68 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  25.4 
 
 
452 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.8 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  25.33 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  23.81 
 
 
452 aa  76.6  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  21.89 
 
 
407 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  23.8 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.97 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  22.79 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  23.43 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  21.1 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  22.65 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.34 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  21.75 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  22.02 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  22.83 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1653  FAD-binding monooxygenase  23.3 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  23.24 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>