More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0792 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
431 aa  873    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  52.9 
 
 
450 aa  475  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 
447 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  51.09 
 
 
437 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  48.95 
 
 
441 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  51.06 
 
 
458 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.07 
 
 
726 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 
441 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.69 
 
 
731 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.99 
 
 
739 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 
440 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 
432 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  49.28 
 
 
441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  48.32 
 
 
432 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  48.17 
 
 
435 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  47.44 
 
 
447 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 
444 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  49.04 
 
 
416 aa  400  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.6 
 
 
735 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  48.45 
 
 
440 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  48.14 
 
 
441 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  48.37 
 
 
435 aa  396  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  48.6 
 
 
448 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  47.42 
 
 
459 aa  395  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  48.48 
 
 
434 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.36 
 
 
733 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  48.02 
 
 
434 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  46 
 
 
432 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.36 
 
 
721 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  46.4 
 
 
445 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  48.89 
 
 
422 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  47.41 
 
 
457 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  45.03 
 
 
453 aa  387  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  46.73 
 
 
435 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  46.93 
 
 
457 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  48.19 
 
 
447 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  45.06 
 
 
443 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  46.93 
 
 
457 aa  381  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  48.58 
 
 
443 aa  380  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  47.87 
 
 
446 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  45.65 
 
 
432 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  44.04 
 
 
457 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  46.93 
 
 
485 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  45.33 
 
 
446 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  46.5 
 
 
449 aa  378  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  42.09 
 
 
463 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  48.33 
 
 
423 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  47.84 
 
 
446 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  44.71 
 
 
734 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  44.23 
 
 
734 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  43.69 
 
 
454 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  45.48 
 
 
446 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  44.13 
 
 
455 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  45.33 
 
 
456 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  45.07 
 
 
447 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  44.68 
 
 
429 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  43.02 
 
 
439 aa  364  1e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  45.5 
 
 
448 aa  365  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  45.63 
 
 
463 aa  365  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  44.55 
 
 
459 aa  363  4e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  46.03 
 
 
505 aa  362  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  42.76 
 
 
437 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  42.76 
 
 
437 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  43.25 
 
 
446 aa  360  3e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  44.39 
 
 
451 aa  359  5e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  42.53 
 
 
437 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  44.52 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  44.52 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  44.52 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  45.75 
 
 
444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1704  ATPase central domain-containing protein  44.27 
 
 
448 aa  355  6.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  42.49 
 
 
426 aa  355  1e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  46.93 
 
 
435 aa  353  4e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0950  recombination factor protein RarA  43.85 
 
 
431 aa  353  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  45.86 
 
 
441 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  45.09 
 
 
434 aa  352  1e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  44.16 
 
 
419 aa  350  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  44.89 
 
 
428 aa  351  2e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  43.55 
 
 
494 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  44.73 
 
 
461 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  41.55 
 
 
447 aa  350  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  43.53 
 
 
423 aa  350  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  45.26 
 
 
459 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  43.56 
 
 
420 aa  349  5e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  42.7 
 
 
445 aa  348  9e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0547  AAA ATPase central domain protein  48.26 
 
 
421 aa  348  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  43.79 
 
 
425 aa  348  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  44.42 
 
 
436 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  44.13 
 
 
500 aa  348  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  43.87 
 
 
443 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  44.89 
 
 
447 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  41.97 
 
 
428 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  43.4 
 
 
443 aa  346  5e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  42 
 
 
451 aa  345  6e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  42.49 
 
 
461 aa  345  7e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  43.19 
 
 
443 aa  344  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  43.26 
 
 
445 aa  343  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  45.58 
 
 
427 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>