More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0780 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  100 
 
 
582 aa  1176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  50.09 
 
 
583 aa  598  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  43.44 
 
 
584 aa  470  1e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  42.66 
 
 
584 aa  467  1e-130  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  42.26 
 
 
601 aa  465  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  41.4 
 
 
583 aa  461  1e-128  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  43.97 
 
 
590 aa  461  1e-128  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  42.52 
 
 
601 aa  456  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  41.81 
 
 
603 aa  456  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  41.4 
 
 
584 aa  457  1e-127  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  42.45 
 
 
598 aa  457  1e-127  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.18 
 
 
588 aa  431  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  39.53 
 
 
549 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  33.56 
 
 
568 aa  306  8e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  32.94 
 
 
567 aa  305  1e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  32.3 
 
 
803 aa  292  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  33.61 
 
 
664 aa  278  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.65 
 
 
552 aa  262  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  29.48 
 
 
719 aa  252  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.05 
 
 
550 aa  251  3e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.31 
 
 
562 aa  247  4e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.05 
 
 
553 aa  243  5e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  31.25 
 
 
547 aa  243  6e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.85 
 
 
592 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  29.3 
 
 
651 aa  237  5e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.3 
 
 
573 aa  235  1e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  29.58 
 
 
932 aa  231  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  30.02 
 
 
546 aa  230  6e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.31 
 
 
556 aa  226  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.35 
 
 
573 aa  223  5e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.53 
 
 
531 aa  219  8e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.52 
 
 
573 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.02 
 
 
573 aa  218  3e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  30.85 
 
 
513 aa  214  5e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  30.61 
 
 
513 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.12 
 
 
509 aa  213  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.83 
 
 
548 aa  211  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.37 
 
 
610 aa  210  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.78 
 
 
594 aa  209  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  29.22 
 
 
508 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  28.82 
 
 
507 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84866e-07 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  28.62 
 
 
511 aa  186  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  33.02 
 
 
513 aa  180  5e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.08 
 
 
510 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  30.02 
 
 
520 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  30.02 
 
 
520 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  30.02 
 
 
520 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  26.61 
 
 
527 aa  163  8e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  29.81 
 
 
534 aa  161  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.58 
 
 
592 aa  159  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  25.16 
 
 
576 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  30.64 
 
 
507 aa  150  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  29.43 
 
 
519 aa  149  1e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  22.43 
 
 
944 aa  149  2e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.87 
 
 
522 aa  147  4e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  28.94 
 
 
503 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  26.52 
 
 
512 aa  143  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.48 
 
 
506 aa  142  2e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.8 
 
 
539 aa  141  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  29.96 
 
 
537 aa  140  5e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  23.54 
 
 
816 aa  137  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  28.92 
 
 
533 aa  133  7e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  27.85 
 
 
533 aa  129  1e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  32.12 
 
 
442 aa  129  1e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  27.24 
 
 
532 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10585  predicted protein  29.6 
 
 
337 aa  127  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  33.2 
 
 
359 aa  126  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5528  DNA ligase (ATP)  29.55 
 
 
329 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5930  DNA ligase (ATP)  29.55 
 
 
329 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.030161  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00097  DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1)(DNA ligase IV)(Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH83]  24.61 
 
 
1009 aa  123  1e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0295925  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  28.54 
 
 
550 aa  123  1e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  23.8 
 
 
544 aa  122  2e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  23.66 
 
 
552 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  30.3 
 
 
353 aa  119  1e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  30.3 
 
 
353 aa  119  1e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  30.3 
 
 
353 aa  119  1e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  31.6 
 
 
766 aa  119  2e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  31.73 
 
 
353 aa  117  4e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  28.21 
 
 
509 aa  117  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  34.07 
 
 
357 aa  116  9e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  26.44 
 
 
530 aa  116  9e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  32.96 
 
 
354 aa  116  1e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5557  DNA ligase (ATP)  30.6 
 
 
328 aa  115  2e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756283  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  25.83 
 
 
532 aa  115  2e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  28.97 
 
 
320 aa  115  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6007  ATP-dependent DNA ligase  25.26 
 
 
539 aa  114  4e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  26.03 
 
 
532 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  32.46 
 
 
763 aa  114  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  25.55 
 
 
538 aa  113  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  25 
 
 
532 aa  113  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  29.12 
 
 
369 aa  113  1e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  27.86 
 
 
316 aa  112  2e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  30.03 
 
 
351 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.1 
 
 
1017 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  25.22 
 
 
514 aa  110  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  24.76 
 
 
517 aa  110  8e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26493  predicted protein  22.78 
 
 
994 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  31.72 
 
 
307 aa  109  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  28.07 
 
 
321 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  28.81 
 
 
360 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>