More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0739 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
362 aa  705  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.09 
 
 
377 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.55 
 
 
388 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.38 
 
 
376 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.76 
 
 
397 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  2.97953e-07 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  26.85 
 
 
371 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  26.83 
 
 
371 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  26.83 
 
 
371 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.83 
 
 
371 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  26.83 
 
 
371 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  26.83 
 
 
371 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  26.83 
 
 
371 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  26.83 
 
 
371 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.6 
 
 
380 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.46 
 
 
360 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  26.83 
 
 
371 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  3.39116e-09  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  25.53 
 
 
379 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  25.56 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  23.65 
 
 
449 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  25.13 
 
 
417 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  25.79 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  25.28 
 
 
372 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  25.28 
 
 
372 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  25.28 
 
 
372 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  23.39 
 
 
360 aa  91.3  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  26.92 
 
 
385 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  25 
 
 
372 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  21.05 
 
 
399 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  7.56014e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  24.13 
 
 
364 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.49187e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
521 aa  87  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 
353 aa  85.5  1e-15  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1731  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.57 
 
 
402 aa  85.9  1e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.32 
 
 
349 aa  84.7  2e-15  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  19.73 
 
 
407 aa  84.7  2e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.81 
 
 
353 aa  84  3e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  25.46 
 
 
392 aa  84  4e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.49 
 
 
379 aa  82.8  8e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3939  RND family efflux transporter MFP subunit  22.89 
 
 
367 aa  82  1e-14  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.407918  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  23.36 
 
 
421 aa  82.4  1e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.33 
 
 
368 aa  82  1e-14  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  24.13 
 
 
350 aa  82  1e-14  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.31 
 
 
349 aa  81.6  2e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.12 
 
 
353 aa  81.3  2e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593708  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  20.11 
 
 
380 aa  81.6  2e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 
354 aa  80.9  3e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.58 
 
 
549 aa  81.3  3e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.06 
 
 
400 aa  79.3  9e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.72 
 
 
428 aa  79  1e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  22.09 
 
 
368 aa  78.6  1e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  22.15 
 
 
354 aa  78.2  2e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  23.06 
 
 
414 aa  78.6  2e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  21.41 
 
 
376 aa  77.8  2e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  23.36 
 
 
421 aa  78.2  2e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  27.16 
 
 
357 aa  77.8  3e-13  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.16 
 
 
386 aa  77.4  3e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  30.3 
 
 
360 aa  77.8  3e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2284  RND family efflux transporter MFP subunit  23.17 
 
 
323 aa  77.8  3e-13  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.489118  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.92 
 
 
420 aa  77  4e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  25.73 
 
 
371 aa  77.4  4e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.44 
 
 
346 aa  77  4e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  23.73 
 
 
431 aa  77  5e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  23.26 
 
 
358 aa  77  5e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  23.26 
 
 
358 aa  76.6  5e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  23.53 
 
 
396 aa  76.6  6e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  23.33 
 
 
380 aa  76.3  8e-13  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.09 
 
 
453 aa  75.9  9e-13  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.35 
 
 
404 aa  75.9  1e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3695  RND family efflux transporter MFP subunit  22.26 
 
 
360 aa  75.5  1e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.65 
 
 
354 aa  75.5  1e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  26.81 
 
 
357 aa  75.5  1e-12  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  25.21 
 
 
353 aa  75.5  1e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  21.78 
 
 
354 aa  75.9  1e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  21.84 
 
 
363 aa  75.1  2e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  25.61 
 
 
338 aa  74.7  2e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  23.08 
 
 
476 aa  74.7  2e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.51 
 
 
437 aa  75.1  2e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  22.77 
 
 
424 aa  74.7  2e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.92 
 
 
322 aa  74.7  2e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.9 
 
 
430 aa  74.3  3e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  22.97 
 
 
359 aa  74.3  3e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  21.57 
 
 
421 aa  74.3  3e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  23.08 
 
 
357 aa  74.3  3e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 
379 aa  74.3  3e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.75 
 
 
586 aa  74.3  3e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0467  RND family efflux transporter MFP subunit  23.42 
 
 
360 aa  73.9  4e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2146  RND family efflux transporter MFP subunit  24.21 
 
 
417 aa  73.9  4e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0449485  normal  0.0115764 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.1 
 
 
361 aa  73.9  4e-12  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3848  RND family efflux transporter MFP subunit  24.34 
 
 
361 aa  73.9  4e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.918542  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  23.01 
 
 
354 aa  73.6  5e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  25.17 
 
 
338 aa  73.6  5e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  21.71 
 
 
354 aa  73.6  5e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  26.29 
 
 
353 aa  73.6  5e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.71 
 
 
354 aa  73.6  6e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  21.71 
 
 
354 aa  73.6  6e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01876  hypothetical protein  22.15 
 
 
359 aa  73.6  6e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  21.15 
 
 
411 aa  73.2  6e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 
432 aa  73.2  7e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  23.32 
 
 
323 aa  73.2  7e-12  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  20.71 
 
 
351 aa  72.8  8e-12  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1279  HlyD family secretion protein  21.56 
 
 
359 aa  72.8  9e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>