More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0714 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  100 
 
 
781 aa  1564    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  31.87 
 
 
461 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  31.07 
 
 
467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  28.22 
 
 
470 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  28.4 
 
 
467 aa  150  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  27.94 
 
 
457 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2415  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
319 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000869235  hitchhiker  0.0000149362 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27.94 
 
 
457 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  26.27 
 
 
471 aa  144  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  27.23 
 
 
436 aa  144  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  30.17 
 
 
320 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  27.85 
 
 
475 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  29.09 
 
 
438 aa  140  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0610  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
321 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0682  hypothetical protein  29.55 
 
 
319 aa  136  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1220  glycosyl transferase family 9  29.26 
 
 
322 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  28.09 
 
 
438 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0312  family 9 glycosyl transferase  27.03 
 
 
319 aa  111  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0634  glycosyl transferase family 9  27.3 
 
 
315 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0618  glycosyl transferase family 9  27.3 
 
 
315 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  28.02 
 
 
532 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  28.47 
 
 
540 aa  93.6  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  27.02 
 
 
360 aa  90.1  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  28.78 
 
 
330 aa  87.4  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 
361 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.56 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2415  glycosyl transferase family 9  25.53 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0888849  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  24.62 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.01 
 
 
343 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.8 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  25.91 
 
 
354 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.07 
 
 
516 aa  75.9  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.78 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  22.53 
 
 
354 aa  73.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.55 
 
 
343 aa  73.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 
405 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  24.6 
 
 
461 aa  72.8  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 
401 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.68 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.07 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.37 
 
 
339 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  25.22 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 
401 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 
401 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0899  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.86 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  21.43 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.84 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  22.7 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 
870 aa  67.4  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.71 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.38 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3877  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
361 aa  67  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.58 
 
 
368 aa  67  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  23.41 
 
 
406 aa  67.4  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4509  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.56 
 
 
358 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  24.43 
 
 
361 aa  66.6  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  23.5 
 
 
347 aa  65.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  24.01 
 
 
348 aa  65.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1411  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
419 aa  65.9  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  20.17 
 
 
348 aa  65.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  33.61 
 
 
930 aa  65.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.77 
 
 
359 aa  65.1  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  24.43 
 
 
359 aa  65.1  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2496  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25 
 
 
357 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.61 
 
 
340 aa  64.7  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  24.47 
 
 
382 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.67 
 
 
346 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  22.22 
 
 
349 aa  64.3  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  22.56 
 
 
349 aa  64.3  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  21.79 
 
 
409 aa  64.3  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.6 
 
 
341 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.57 
 
 
331 aa  63.9  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.99 
 
 
343 aa  63.5  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  23.69 
 
 
341 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.99 
 
 
343 aa  63.5  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.05 
 
 
356 aa  63.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 
344 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  22.53 
 
 
372 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.74 
 
 
354 aa  63.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  22.08 
 
 
372 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  22.07 
 
 
356 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.41 
 
 
299 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  25.52 
 
 
382 aa  62  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  25.15 
 
 
363 aa  62  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.65 
 
 
415 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.81 
 
 
358 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  22.78 
 
 
737 aa  61.6  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  26.01 
 
 
436 aa  61.6  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  24.89 
 
 
393 aa  61.2  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.38 
 
 
341 aa  61.2  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1430  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.43 
 
 
359 aa  61.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.433095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.63 
 
 
357 aa  61.2  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 
362 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0479  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.94 
 
 
317 aa  60.8  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>