150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0659 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  100 
 
 
171 aa  321  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  42.94 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  41.45 
 
 
184 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  41.03 
 
 
169 aa  98.6  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  41.03 
 
 
169 aa  98.6  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  37.43 
 
 
184 aa  96.7  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  37.35 
 
 
169 aa  95.5  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  38.51 
 
 
178 aa  91.3  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  35.1 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  35.43 
 
 
189 aa  89  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  32.35 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  35.33 
 
 
174 aa  88.2  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  34.97 
 
 
207 aa  87.4  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  33.71 
 
 
182 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  34.3 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  35.12 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  36.93 
 
 
182 aa  85.1  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  28.73 
 
 
194 aa  84.7  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  34.86 
 
 
184 aa  84  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  33.12 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  32.94 
 
 
193 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  36.75 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  35.37 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  35.37 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  32.35 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  35.62 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  35.71 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  33.79 
 
 
197 aa  79  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  35.54 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  30.99 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  36.49 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  30.64 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  31.11 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  29.83 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  30.91 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  27.47 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  32.24 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  37.5 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  31.47 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  34.21 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  29.05 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  34.29 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  32 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  31.82 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  36.73 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  32.21 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  31.95 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  37.34 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  27.84 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  27.27 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  28.41 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  29.67 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  35.46 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  31.16 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  42.35 
 
 
216 aa  63.9  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  27.27 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  35.57 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  30.3 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  31.67 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  30.07 
 
 
208 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  43.21 
 
 
199 aa  62  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  30 
 
 
189 aa  61.6  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  32.53 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  36.11 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  29.55 
 
 
190 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  30.6 
 
 
235 aa  60.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  36.03 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  29.67 
 
 
192 aa  58.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  28.48 
 
 
196 aa  58.9  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  38.55 
 
 
208 aa  58.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  31.25 
 
 
203 aa  58.2  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  30.68 
 
 
184 aa  57.8  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  30.68 
 
 
184 aa  57.8  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  30.77 
 
 
184 aa  57.8  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  28.92 
 
 
224 aa  57.8  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  31.64 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  30.72 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  31.75 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  27.59 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  34.51 
 
 
196 aa  55.8  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  27.42 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  28.97 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  28.67 
 
 
210 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  25.95 
 
 
197 aa  55.1  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  29.82 
 
 
212 aa  54.7  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  26.09 
 
 
197 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  26.92 
 
 
203 aa  54.3  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  26.09 
 
 
197 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  29.8 
 
 
197 aa  53.9  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  34.56 
 
 
189 aa  54.3  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  29.8 
 
 
197 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  27.86 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  27.86 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  26.21 
 
 
202 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  30.61 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  31.64 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  26.21 
 
 
202 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  28.07 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  26.09 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  28.08 
 
 
216 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>