127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0615 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  100 
 
 
257 aa  526  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  61.66 
 
 
259 aa  340  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  60.87 
 
 
259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0441  putative GTP cyclohydrolase  52.19 
 
 
256 aa  294  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  53.75 
 
 
259 aa  280  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0620  hypothetical protein  54.05 
 
 
261 aa  273  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  49.21 
 
 
269 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  49.8 
 
 
285 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  49.8 
 
 
266 aa  260  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  48.05 
 
 
257 aa  257  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  46.85 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  46.46 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  46.67 
 
 
269 aa  252  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  47.62 
 
 
276 aa  251  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  45.85 
 
 
258 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  46.25 
 
 
261 aa  248  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  46.06 
 
 
267 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  46.09 
 
 
256 aa  244  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  45.38 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  48.03 
 
 
266 aa  241  9e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0878  GTP cyclohydrolase  46.72 
 
 
269 aa  238  6.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76872  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  43.48 
 
 
264 aa  238  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  43.48 
 
 
264 aa  238  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0209  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 
264 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  45.28 
 
 
270 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  46.25 
 
 
273 aa  236  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  44.53 
 
 
266 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  45.28 
 
 
268 aa  236  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1986  putative GTP cyclohydrolase  45.28 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  46.64 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3062  GTP cyclohydrolase  46.03 
 
 
270 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000921807  unclonable  0.000000032257 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  42.91 
 
 
259 aa  227  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3230  putative GTP cyclohydrolase  43.7 
 
 
274 aa  225  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  42.19 
 
 
260 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  46.9 
 
 
263 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0093  protein of unknown function DUF198  43.97 
 
 
264 aa  223  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  43.31 
 
 
268 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  43.31 
 
 
268 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2210  putative GTP cyclohydrolase  43.31 
 
 
269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  42.52 
 
 
277 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0366  putative GTP cyclohydrolase  42.52 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1514  putative GTP cyclohydrolase  42.52 
 
 
277 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0331  putative GTP cyclohydrolase  42.52 
 
 
266 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0841  putative GTP cyclohydrolase  42.52 
 
 
266 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1707  putative GTP cyclohydrolase  42.52 
 
 
269 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  42.52 
 
 
269 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2391  putative GTP cyclohydrolase  42.52 
 
 
269 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.075557  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1269  protein of unknown function DUF198  42.23 
 
 
256 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000812404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0489  GTP cyclohydrolase  42.29 
 
 
266 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427836  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  42.91 
 
 
269 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  40.55 
 
 
268 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3251  putative GTP cyclohydrolase  42.52 
 
 
269 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4485  putative GTP cyclohydrolase  42.91 
 
 
269 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3880  putative GTP cyclohydrolase  42.91 
 
 
269 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.141532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3647  putative GTP cyclohydrolase  42.91 
 
 
269 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3777  putative GTP cyclohydrolase  42.52 
 
 
269 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730227  normal  0.0392269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  42.58 
 
 
270 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2614  putative GTP cyclohydrolase  42.35 
 
 
267 aa  204  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.307548  normal  0.812477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  42.29 
 
 
268 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  43.58 
 
 
268 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1703  hypothetical protein  39.3 
 
 
275 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  43.19 
 
 
268 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  43.19 
 
 
268 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2630  GTP cyclohydrolase  40.85 
 
 
300 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0272371  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1681  protein of unknown function DUF198  40.08 
 
 
263 aa  183  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1421  protein of unknown function DUF198  38.91 
 
 
275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0212  putative GTP cyclohydrolase  34.73 
 
 
292 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0589  putative GTP cyclohydrolase  32.31 
 
 
292 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0603  putative GTP cyclohydrolase  32.31 
 
 
292 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0579  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.18 
 
 
480 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1567  putative GTP cyclohydrolase  29.23 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0199115  normal  0.180744 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0781  protein of unknown function DUF198  32.28 
 
 
290 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.783967  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1183  GTP cyclohydrolase  29.61 
 
 
319 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4297  putative GTP cyclohydrolase  27.34 
 
 
321 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5367  protein of unknown function DUF198  29.39 
 
 
333 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0556  hypothetical protein  28.57 
 
 
263 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0639  putative GTP cyclohydrolase  26.64 
 
 
359 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.71626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2173  GTP cyclohydrolase  27.8 
 
 
313 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1937  putative GTP cyclohydrolase  23.08 
 
 
367 aa  96.3  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2334  GTP cyclohydrolase  25.17 
 
 
328 aa  95.1  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.163269  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2411  putative GTP cyclohydrolase  24.71 
 
 
367 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.556277  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2312  GTP cyclohydrolase I  25 
 
 
359 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1852  putative GTP cyclohydrolase  24.51 
 
 
359 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0501  putative GTP cyclohydrolase  24.51 
 
 
359 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291801  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0083  GTP cyclohydrolase  26.62 
 
 
317 aa  94  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0355  GTP cyclohydrolase  27.99 
 
 
322 aa  92.8  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.498467  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2260  GTP cyclohydrolase  26.64 
 
 
340 aa  92.4  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1857  putative GTP cyclohydrolase  24.9 
 
 
362 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229026 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0480  GTP cyclohydrolase  26.19 
 
 
326 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0018  GTP cyclohydrolase  26.26 
 
 
311 aa  90.1  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1583  GTP cyclohydrolase  26.37 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0054  GTP cyclohydrolase  28.42 
 
 
317 aa  85.5  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1148  GTP cyclohydrolase  28.42 
 
 
309 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.713445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0488  protein of unknown function DUF198  25.67 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0915  GTP cyclohydrolase  26.01 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.599141  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1031  GTP cyclohydrolase  26.35 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.489752  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2276  GTP cyclohydrolase  26.3 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.593749  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2853  protein of unknown function DUF198  25.95 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0923  putative GTP cyclohydrolase  24.47 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134709  normal  0.123091 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1031  GTP cyclohydrolase  25.68 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59743  hitchhiker  0.00756508 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>