More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0599 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  100 
 
 
580 aa  1137    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  56.52 
 
 
478 aa  491  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  29.06 
 
 
948 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  28.15 
 
 
781 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  29.07 
 
 
833 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  28.52 
 
 
834 aa  166  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  26.69 
 
 
1055 aa  163  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  29.7 
 
 
952 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  25.94 
 
 
827 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  27.15 
 
 
869 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  29.01 
 
 
936 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  27.21 
 
 
977 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  28.52 
 
 
947 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  25.52 
 
 
828 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  25.24 
 
 
828 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  27.29 
 
 
823 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  27.21 
 
 
830 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  25.95 
 
 
837 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  25.95 
 
 
837 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  27.1 
 
 
833 aa  141  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  25.05 
 
 
828 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  26.43 
 
 
837 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  27.15 
 
 
940 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  26.51 
 
 
791 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  24.81 
 
 
779 aa  131  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  30.26 
 
 
568 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  27.99 
 
 
912 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  24.22 
 
 
919 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  29.93 
 
 
919 aa  127  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  24.23 
 
 
753 aa  127  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  28.12 
 
 
915 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  27.09 
 
 
846 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.98 
 
 
703 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  27.18 
 
 
931 aa  124  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  25.55 
 
 
830 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 
921 aa  124  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  27.99 
 
 
922 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  27.13 
 
 
920 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  25.31 
 
 
852 aa  120  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  31.51 
 
 
910 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  25.77 
 
 
700 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.21 
 
 
920 aa  117  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  25.26 
 
 
700 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  27.08 
 
 
869 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  24.57 
 
 
824 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.8 
 
 
877 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  28.09 
 
 
897 aa  114  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  30.8 
 
 
803 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  25.49 
 
 
800 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  26.92 
 
 
473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  29.24 
 
 
869 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  30.55 
 
 
508 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  31.54 
 
 
358 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  26.1 
 
 
992 aa  102  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  30.04 
 
 
387 aa  100  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  30.92 
 
 
388 aa  99  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  30.16 
 
 
362 aa  99.4  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  23.66 
 
 
495 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  26.08 
 
 
478 aa  96.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.13 
 
 
877 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  23.51 
 
 
495 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  24.21 
 
 
812 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.13 
 
 
800 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  30.66 
 
 
875 aa  95.5  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  23.21 
 
 
495 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  29.55 
 
 
270 aa  92.8  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  30.08 
 
 
379 aa  92  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  24.42 
 
 
587 aa  91.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  24.94 
 
 
492 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  28.64 
 
 
277 aa  89  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  28.67 
 
 
387 aa  89  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  31.64 
 
 
393 aa  87.8  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  26.8 
 
 
992 aa  87  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  28.52 
 
 
365 aa  87  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  32.2 
 
 
407 aa  87  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  27.04 
 
 
849 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  30.24 
 
 
333 aa  85.9  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  31.36 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  29.11 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  31.64 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  29.57 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  23.82 
 
 
579 aa  83.6  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.11 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.11 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  28.12 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.11 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.11 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  29.72 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  30.56 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  27.62 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  31.11 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  31.67 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  28.72 
 
 
281 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.8 
 
 
375 aa  79.7  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  31.63 
 
 
191 aa  80.1  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  31.11 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  29.95 
 
 
431 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.28 
 
 
351 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  29.38 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  29.22 
 
 
277 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>