More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0598 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  100 
 
 
478 aa  924  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  56.52 
 
 
580 aa  479  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  5.41966e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  29.55 
 
 
823 aa  154  3e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  27.05 
 
 
1055 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  26.93 
 
 
779 aa  136  7e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  28.45 
 
 
936 aa  135  2e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  26.57 
 
 
948 aa  134  4e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  29.25 
 
 
833 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  29.13 
 
 
781 aa  133  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  29.91 
 
 
952 aa  132  1e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  28.31 
 
 
947 aa  131  2e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  29.15 
 
 
830 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  28.08 
 
 
977 aa  127  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  29.54 
 
 
830 aa  126  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  27.06 
 
 
753 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  28.03 
 
 
473 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  33.6 
 
 
803 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  25.87 
 
 
827 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  29.54 
 
 
910 aa  123  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  30.98 
 
 
915 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  26.28 
 
 
828 aa  122  1e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  25.68 
 
 
828 aa  122  2e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  28.4 
 
 
834 aa  120  4e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  28.42 
 
 
495 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  29.01 
 
 
912 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  30.12 
 
 
919 aa  119  8e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  29.32 
 
 
833 aa  120  8e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  3.3468e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  29.97 
 
 
920 aa  119  8e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  30.03 
 
 
921 aa  118  2e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  26.94 
 
 
869 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  29.01 
 
 
922 aa  117  4e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  26.51 
 
 
837 aa  115  1e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  26.51 
 
 
837 aa  115  1e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  27.93 
 
 
846 aa  115  2e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  26.04 
 
 
837 aa  115  2e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  2.8911e-06 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.97 
 
 
703 aa  115  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  30.19 
 
 
852 aa  114  4e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  29.01 
 
 
919 aa  114  4e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.51 
 
 
920 aa  114  4e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  24.75 
 
 
849 aa  114  4e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  26.56 
 
 
791 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  27.43 
 
 
940 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  28.28 
 
 
931 aa  113  8e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.81 
 
 
877 aa  113  1e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  28.38 
 
 
992 aa  111  2e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  28.37 
 
 
897 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  27.6 
 
 
869 aa  110  4e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  25.73 
 
 
828 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  28.11 
 
 
576 aa  109  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  27.27 
 
 
824 aa  109  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  29.22 
 
 
869 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  26.28 
 
 
495 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.66 
 
 
877 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  24.84 
 
 
800 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.66 
 
 
800 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  25.94 
 
 
495 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  25.44 
 
 
875 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  25.15 
 
 
478 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  26.25 
 
 
700 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  26.38 
 
 
700 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  27.15 
 
 
992 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  31.17 
 
 
387 aa  100  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  31.42 
 
 
356 aa  98.2  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  22.56 
 
 
492 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2624  polysaccharide export protein  23.9 
 
 
573 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.145558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  31.71 
 
 
362 aa  95.5  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  32.17 
 
 
358 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  28.1 
 
 
508 aa  93.6  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  31.97 
 
 
388 aa  93.6  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  29.88 
 
 
379 aa  91.7  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  27.11 
 
 
552 aa  90.5  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  26.29 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  24.94 
 
 
551 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  28.51 
 
 
281 aa  89.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  28.88 
 
 
264 aa  85.9  2e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  28.4 
 
 
351 aa  84.7  4e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  25.31 
 
 
268 aa  82.8  1e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  24.28 
 
 
605 aa  83.2  1e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  2.40824e-05 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  30.56 
 
 
270 aa  83.2  1e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  25.42 
 
 
268 aa  82.8  1e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  29.6 
 
 
333 aa  82  2e-14  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  30.36 
 
 
268 aa  82.4  2e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  25.64 
 
 
568 aa  82.4  2e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  32.61 
 
 
295 aa  80.9  4e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  26.74 
 
 
283 aa  81.3  4e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  27.06 
 
 
347 aa  80.5  6e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.78188e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  27.53 
 
 
277 aa  80.5  6e-14  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  30.64 
 
 
393 aa  80.1  8e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  24.24 
 
 
812 aa  79.7  1e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  28.09 
 
 
317 aa  79.3  1e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  29.41 
 
 
373 aa  79.3  1e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  25.44 
 
 
552 aa  79.7  1e-13  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  27.91 
 
 
282 aa  78.2  3e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.69 
 
 
375 aa  77.8  4e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  26.56 
 
 
268 aa  77.8  4e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  23.27 
 
 
587 aa  77.4  5e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  25.44 
 
 
552 aa  76.6  8e-13  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  31.07 
 
 
407 aa  76.6  8e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  29.05 
 
 
282 aa  76.3  1e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  26.02 
 
 
277 aa  75.9  2e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>